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wulingnan金虫 (初入文坛)
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关于DMol的TS confirmation
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做了表面反应的过渡态搜索，有一些问题和疑惑一直没有解决，希望能有前辈 和高手指点一二 用的是MS的DMol模块 主要的问题有 1.TS search 的时候如果体系内有constraint的原子 要不要解除固定，固定和不固定两种情况对结果有什么影响？ 2.TS confirmation 貌似要求所有的原子都不能固定，如果放开所有原子那么会发现energy minimum对应的上述固定的原子也会发生移动，这样就使得固定没有了意义，如何协调寻TS search 和 confirmation 中原子固定的手段 3.TS search 和结构优化的basis set 以及quality 可否不相同 能否采用较高的结构优化精度以及较低的TS search 和confirmation 精度 4.TS confirmation找到的energy minimum（如果只有一个） 是否要与反应物与生成物分别作TS search 及confirmation？ 5.可否先用低精度的TS search 找到过渡态，用低精度的TS confirmation 找中间体 再用高精度的TS search 去搜过渡态？ 希望能有高手解决我心中的这些疑惑 也欢迎大家交流沟通 万分感谢！！  [ Last edited by wulingnan on 2013-12-4 at 22:20 ] |
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