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转基因猴子

木虫 (正式写手)

[求助] SWISSMODEL同源建模遇到的问题,求助

本人通过PDB数据库找到我的一个序列的三维结构模板(同源百分之九十几),之后呢以此为模板使用SWISSMODEL automated mode进行同源建模。现在问题来了,使用这个序列建模时候一切正常,但是我将序列最后一个氨基酸改变之后,建模出来的结构缺失了这个改变过的最后一个氨基酸。这个是为什么呢?我需要得到这个最后一个氨基酸改变的序列的三维结构,有什么其他方法吗?求助各位,先谢过!
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longytu

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导! 2013-12-03 18:33:20
转基因猴子: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 我试试 2013-12-04 11:20:23
swiss-model建模经常存在此问题,丢失一些不是同源区域的氨基酸
可以考虑用Modeller来建模
2楼2013-12-03 17:55:11
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


可以用modeller建模
3楼2014-07-25 09:46:11
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