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liuevans木虫 (正式写手)
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线粒体基因组D-loop区遇到高度重复序列,求指点 已有1人参与
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线粒体基因组D-loop区遇到高度重复序列,无法测通,请高人指点,具体情况如下。 我最初的打算是测一个蛛形纲动物的线粒体基因组,现在基本测完,只剩下D-loop区了,这个片段我设计的引物是在D-loop区侧翼,总长3k,扩增成功,正常双向测序,分别测了一个反应就测不下去了,因为两端重复序列太多,无法设计walking引物,分析已经测通的序列结果,两端都有tandem repeats,估计这就是测不通的原因。据我了解,测序对这种高度串联重复序列很难解决,就算测通也是运气好。所以,求高人指导,希望早日测通,在此谢谢了! |
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