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amq7392

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 米氏常数的计算过程中的误差问题 已有1人参与

在酶的动力学参数Km和Vmax测定过程中,需要在一系列不同的底物浓度下测得反应初速率,然后对底物浓度S和反应速率V进行双倒数作图(在excel中进行线性拟合)。问题是:我在每个底物浓度下,都重复测定了三次反应速率,用来进行双倒数作图的v是平均值,那么我最后如何计算Km和Vmax误差值?
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amq7392: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-11-26 10:59:38
这个问题我没有注意过,我是像你那样每次实验都相同的反应设平行取均值,计算Vm和Km。但是做了2次,如果2次都是差不多的Vm和Km,就相信这个酶就差不多是这样了,再从这2组中选取一组作为取信,另一组作为印证。如果两次测得的结果相差太远,则做第三次作为终判。误差的问题我从来都没有注意过,你看SCI文章中相关数据有没有出现误差的?把这些文章发上来,我学习一下。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
3楼2013-11-25 19:04:06
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普通回帖

远志小草

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amq7392: 金币+2, ★有帮助 2013-11-26 11:00:02
分别作图算出Vm和Km,然后求误差,

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-11-24 10:38:02
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amq7392

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2013-11-25 19:04:06
这个问题我没有注意过,我是像你那样每次实验都相同的反应设平行取均值,计算Vm和Km。但是做了2次,如果2次都是差不多的Vm和Km,就相信这个酶就差不多是这样了,再从这2组中选取一组作为取信,另一组作为印证。如果 ...

有些sci文章中Km和Vmax是带有误差值的,有些没有。比如下面这篇文章中的动力学参数都带误差值:http://link.springer.com/article/10.1007/s00253-011-3568-9
再追问一下,你所说的【每次实验都相同的反应设平行取均值,计算Vm和Km。但是做了2次】,你做的2次重复,是每次都要重新配制一系列不同浓度的底物溶液,分别测定Vm和Km,还是只配一次底物溶液,然后测两次?
4楼2013-11-25 21:21:37
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

引用回帖:
4楼: Originally posted by amq7392 at 2013-11-25 21:21:37
有些sci文章中Km和Vmax是带有误差值的,有些没有。比如下面这篇文章中的动力学参数都带误差值:http://link.springer.com/article/10.1007/s00253-011-3568-9
再追问一下,你所说的【每次实验都相同的反应设平行取 ...

连酶都是不同批次纯化的,何况溶液。那篇文章我用kinetic搜索了一下,没发现在哪里讲了怎么做的,怪了。你看过的SCI文章中,带误差的多还是不带的多?
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
5楼2013-11-26 01:05:16
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amq7392

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2013-11-26 01:05:16
连酶都是不同批次纯化的,何况溶液。那篇文章我用kinetic搜索了一下,没发现在哪里讲了怎么做的,怪了。你看过的SCI文章中,带误差的多还是不带的多?...

不带误差的居多吧。那篇文章没有具体讲它的误差是怎么得出来的。一般的实验数据误差好计算,直接求3次数据的标准差就可以了。但是像Km和Vmax这种,是需要经过线性拟合后间接得出的,真是不清楚它的误差是怎么算的。
6楼2013-11-26 10:59:03
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

引用回帖:
6楼: Originally posted by amq7392 at 2013-11-26 10:59:03
不带误差的居多吧。那篇文章没有具体讲它的误差是怎么得出来的。一般的实验数据误差好计算,直接求3次数据的标准差就可以了。但是像Km和Vmax这种,是需要经过线性拟合后间接得出的,真是不清楚它的误差是怎么算的。...

要么你写信问作者,最直接。
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7楼2013-11-26 14:26:12
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amq7392

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2013-11-26 14:26:12
要么你写信问作者,最直接。...

嗯,好办法,试试。谢谢!
8楼2013-11-26 16:23:59
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101814z

新虫 (初入文坛)

你好  这个问题你解决了吗  我现在也急需知道 怎么解决的
9楼2016-02-28 14:26:03
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101814z

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by 远志小草 at 2013-11-24 10:38:02
分别作图算出Vm和Km,然后求误差,

三次测量误差比较大求出来相差很大怎么办
10楼2016-02-28 14:27:28
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