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490105179

木虫 (正式写手)

[求助] VASP运行出错

我用VASP优化结构,任务刚开始就被杀死了,错误提示如下:
running on   12 nodes
distr:  one band on    1 nodes,   12 groups
vasp.5.2.11 10Dec10 complex
POSCAR found type information on POSCAR  H  C  N  O
POSCAR found :  4 types and      14 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(           1 )
WAVECAR not read
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 1 with PID 10678 on node gg1038 exited on signal 9 (Killed).
--------------------------------------------------------------------------
12 total processes killed (some possibly by mpirun during cleanup)
start time  Wed Nov 20 09:49:58 CST 2013
end   time  Wed Nov 20 09:51:47 CST 2013
请各位大神帮忙看看问题出在哪
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490105179

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gclai at 2013-11-20 11:34:32
是不是截断能太高了?还是你的K点设置不合适以及内存不够都有可能造成这样的问题。如果是集群运行的话,尽量在一个节点上,你这用了12个节点,要是网络不顺畅的话也可能。

我一直用12个节点,算其它的都没问题,就是这次算有机小分子出现了问题,截断能是参照MS的,K点也是
3楼2013-11-20 14:16:56
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gclai

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
490105179: 金币+10 2013-11-20 20:30:51
是不是截断能太高了?还是你的K点设置不合适以及内存不够都有可能造成这样的问题。如果是集群运行的话,尽量在一个节点上,你这用了12个节点,要是网络不顺畅的话也可能。
努力去做,做最好的。
2楼2013-11-20 11:34:32
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490105179

木虫 (正式写手)

将K点改小后开始运算了
4楼2013-11-20 20:30:40
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