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superzrd

金虫 (小有名气)

[求助] 求助帮忙分析一个系统进化树，跪谢！！！

小弟最近筛选到一个真菌，送去做分子鉴定（ITS），测序公司返回的进化树如下图，请高手帮忙分析一下结果。
求助帮忙分析一个系统进化树，跪谢！！！
进化树.gif图片太小，看不清，重新上传附件。

[ Last edited by superzrd on 2013-11-13 at 22:55 ]
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    • 2013-11-13 22:54:28, 58.39 K

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化身胡杨！
1楼 2013-11-13 22:51:47
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回帖置顶 ( 共有1个 )

superzrd

金虫 (小有名气)
superzrd: 回帖置顶 2013-11-14 09:04:29
补充，这个拼接后的测序结果：
TCCGTAggggaACCTGCGGAAGGATCATTACTGAGTGCGGGCTGCCTCCGGGCGCCCAACCTCCCACCCGTGAATACCTAACACTGTTGCTTCGGCGGGGAACCCCCTCGGGGGCGAGCCGCCGGGGACTACTGAACTTCATGCCTGAGAGTGATGCAGTCTGAGTCTGAATATAAAATCAGTCAAAACTTTCAACAATGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAACTGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGCATTCCGGGGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGACTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTCTTCAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGG
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化身胡杨！
7楼2013-11-14 08:29:34
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普通回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
楼主这是进化树么？乱七八槽的啊。
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2楼2013-11-13 23:14:33
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

你附件加上你自己菌ITS测序的结果吧
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3楼2013-11-13 23:16:24
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神
单从树上看，你的L8和基因库里的是同一种菌，ITS过于保守了，这比对都一样。
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4楼2013-11-13 23:23:57
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20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
superzrd: 金币+5, ★有帮助, 希望你可以帮到我，生物信息学这方面从没碰过。 2013-11-14 09:07:03
楼上有一定道理，楼主还是拿ITS序列自己比对画树吧，我做过两年的真菌，不介意我可以帮助你，站内联系
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

superzrd
但行好事，莫问前程
5楼2013-11-13 23:41:06
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superzrd

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 20093651 at 2013-11-13 23:41:06
楼上有一定道理，楼主还是拿ITS序列自己比对画树吧，我做过两年的真菌，不介意我可以帮助你，站内联系

好的，很感激！站内联系您
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化身胡杨！
6楼2013-11-14 08:16:13
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superzrd

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2013-11-13 23:14:33
楼主这是进化树么？乱七八槽的啊。

我也是第一次见这样的，这是测序公司提供的。
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化身胡杨！
8楼2013-11-14 09:05:31
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hnzhaolongfei

木虫 (著名写手)

将军
这不叫进化树，是聚类分析图
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天行健，君子以自强不息；地势坤，君子以厚德载物
9楼2013-11-14 10:47:27
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