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superzrd

金虫 (小有名气)

[求助] 求助帮忙分析一个系统进化树,跪谢!!!

小弟最近筛选到一个真菌,送去做分子鉴定(ITS),测序公司返回的进化树如下图,请高手帮忙分析一下结果。
求助帮忙分析一个系统进化树,跪谢!!!
进化树.gif图片太小,看不清,重新上传附件。

[ Last edited by superzrd on 2013-11-13 at 22:55 ]
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  • 2013-11-13 22:54:28, 58.39 K

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化身胡杨!
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回帖置顶 ( 共有1个 )

superzrd

金虫 (小有名气)

superzrd: 回帖置顶 2013-11-14 09:04:29
补充,这个拼接后的测序结果:
TCCGTAggggaACCTGCGGAAGGATCATTACTGAGTGCGGGCTGCCTCCGGGCGCCCAACCTCCCACCCGTGAATACCTAACACTGTTGCTTCGGCGGGGAACCCCCTCGGGGGCGAGCCGCCGGGGACTACTGAACTTCATGCCTGAGAGTGATGCAGTCTGAGTCTGAATATAAAATCAGTCAAAACTTTCAACAATGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAACTGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGCATTCCGGGGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATTGCTGCCCATCAAGCCCGGCTTGTGTGTTGGGTCGTCGTCCCCCCCGGGGGACGGGCCCGAAAGGCAGCGGCGGCACCGTGTCCGGTCCTCGAGCGTATGGGGCTTTGTCACCCGCTCGACTAGGGCCGGCCGGGCGCCAGCCGACGTCTCCAACCATTTTTCTTCAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGG
化身胡杨!
7楼2013-11-14 08:29:34
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普通回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼主这是进化树么?乱七八槽的啊。
2楼2013-11-13 23:14:33
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

你附件加上你自己菌ITS测序的结果吧
3楼2013-11-13 23:16:24
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

单从树上看,你的L8和基因库里的是同一种菌,ITS过于保守了,这比对都一样。
4楼2013-11-13 23:23:57
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20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
superzrd: 金币+5, 有帮助, 希望你可以帮到我,生物信息学这方面从没碰过。 2013-11-14 09:07:03
楼上有一定道理,楼主还是拿ITS序列自己比对画树吧,我做过两年的真菌,不介意我可以帮助你,站内联系

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

但行好事,莫问前程
5楼2013-11-13 23:41:06
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superzrd

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 20093651 at 2013-11-13 23:41:06
楼上有一定道理,楼主还是拿ITS序列自己比对画树吧,我做过两年的真菌,不介意我可以帮助你,站内联系

好的,很感激!站内联系您
化身胡杨!
6楼2013-11-14 08:16:13
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superzrd

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2013-11-13 23:14:33
楼主这是进化树么?乱七八槽的啊。

我也是第一次见这样的,这是测序公司提供的。
化身胡杨!
8楼2013-11-14 09:05:31
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hnzhaolongfei

木虫 (著名写手)

将军

这不叫进化树,是聚类分析图
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物
9楼2013-11-14 10:47:27
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