24小时热门版块排行榜

返回列表

wusai777

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 4.5
帖子: 5
在线: 3.3小时
虫号: 1983983
注册: 2012-09-08
专业: 中药质量评价

[求助] Blast 出来的质量不高构不成发育树？！！！！

各位帮帮忙，我BLASt 出来的序列构不成发育树，我同学说我blast出来的质量不高所以构不成发育树。怎么选BLAST出来的结果啊？我是一般选第一个或第二个
！会不会是测序出来的16sDNA结果片段太短了啊？

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

如何通过序列确定一个菌是否是新种，并blast分析构建系统发育树已经有6人回复
一个菌株和最高同源性的菌，构建系统发育树两个菌不在一起已经有10人回复
系统发育树的建立和分析已经有15人回复
系统发育树值都低于70%，求助已经有11人回复
关于构建系统发育树的问题，小白求教？为什么变形菌门老是不在一个分支已经有10人回复
菜鸟求助——我系统发育树构建不出来——构建出来的怎么是这样的已经有15人回复
细菌多样性，构建系统进化树中如何选择outgroup？急！！！！！！！已经有15人回复
【求助/交流】真菌分子鉴定问题已经有16人回复
【求助/交流】系统进化树已经有16人回复

1楼 2013-11-04 09:07:35

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

MicEPI: 8
应助: 350 (大学生)
贵宾: 0.047
金币: 3202.9
散金: 1849
红花: 88
沙发: 2
帖子: 1599
在线: 233.4小时
虫号: 953932
注册: 2010-02-08
性别: GG
专业: 生物物理、生物化学与分子

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wusai777: 金币+1, ★有帮助 2013-11-05 13:20:19
laozuzunzhe: 金币+3, 鼓励热心交流！ 2013-11-06 14:22:04

16s?做原核呢，我们现在都用这个网站去比对了
http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/
注册一个账号后，登陆，点击左上角identify，
>菌株名
序列，然后比对，看results就行了，或者给我联系方式，我可以教你。

赞一下

回复此楼

2楼2013-11-04 12:07:38

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wusai777

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 4.5
帖子: 5
在线: 3.3小时
虫号: 1983983
注册: 2012-09-08
专业: 中药质量评价

引用回帖:

2楼: Originally posted by dllchina at 2013-11-04 12:07:38
16s?做原核呢，我们现在都用这个网站去比对了
http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/
注册一个账号后，登陆，点击左上角identify，
>菌株名
序列，然后比对，看results就行了，或者给我联系方式，我可以教你。...

我是16s放线菌，但是我导师要求我在NCBI比对然后在LPSN查找模式菌株。。。

赞一下

回复此楼

3楼2013-11-05 13:23:02

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖