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山水88

木虫 (正式写手)

[求助] Red重组老是不成功,求救

用Red重组敲除基因,做了一个多月了,还是没有成功,前期是抗性基因片段PCR量低,后来换了酶解决了,转了pKD46之后的菌株诱导表达到OD0.6制备感受态转化PCR片段,过程应该都是比较常规的了,可是这么久就是不成功,请问有做过的指点一下,谢谢了,浪费不起时间了
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Haibara_Ai

铜虫 (小有名气)

wtLAC promoter得话全程用LB培养基,Plac是Crp激活,LacI抑制,Crp是受cAMP(葡萄糖抑制)调控
另外用Plac是没什么道理的,这个promoter不是个很好地promoter(乱起八糟调控太多,strength和leaky都不明,我觉得相比pkd46用得pbad优势不大,其实真要有空这个优化起来也不难)。
做KO个人用过现成的里面pSIM19的效率最好(用得wtPL)
http://www.nature.com/nprot/jour ... nprot.2008.227.html
30楼2013-11-19 11:40:07
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guohuayin

木虫 (著名写手)

博士,副教授

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 2013-11-04 08:36:13
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6366582
我做过Red重组敲除大肠杆菌基因,上面是我发的帖子,混总了一下相关问题,你可以参考一下,如果有问题,欢迎交流。
内生菌资源和核酸分子的利用
2楼2013-11-01 20:29:45
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山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by guohuayin at 2013-11-01 20:29:45
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6366582
我做过Red重组敲除大肠杆菌基因,上面是我发的帖子,混总了一下相关问题,你可以参考一下,如果有问题,欢迎交流。

你好,看过您的帖子了,对您的工作表示惊喜。我目前的情况是抗性基因PCR片段量应该够了,感受态也是按照文献方法做的,菌株就是常用的BW25113,引物设计50+20bp,转化后在抗性平板上长的挺多的,但全是假阳性,因此想请教一下有什么需要注意或者可能会影响重组效率的步骤,谢谢!
3楼2013-11-01 21:09:04
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山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by guohuayin at 2013-11-01 20:29:45
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6366582
我做过Red重组敲除大肠杆菌基因,上面是我发的帖子,混总了一下相关问题,你可以参考一下,如果有问题,欢迎交流。

还有一个就是,我想敲除的是三个串联基因,大小在2.5kb,应该说也不是很大了,不知道这个会有影响么。另外一个就是我使用的是四环素抗性基因片段,以前这个抗生素也没用过,所以对它的使用注意事项也不是很清楚,如果是抗性失效的话,长出假阳性也就可以理解了,但同时我做DH5a对照是没有菌落长出来的,因此重组效率不高应该是主要问题了,当然,四环素使用注意事项也烦请老师指点一二,谢谢!
4楼2013-11-01 21:17:33
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