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茄子MM

金虫 (正式写手)

[求助] 晶体解析如何固定五元环

如何固定五元环，现在的情况是五元环无序，想通过命令固定一下，请多指示，谢谢

[ Last edited by 茄子MM on 2013-10-28 at 21:17 ]
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1楼 2013-10-28 21:14:16
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caomeipai

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 184696105 at 2013-10-28 21:37:17
C5     1   0.783982  0.389310  0.472723 11.000000  0.056310
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C6     1   0.670845  0.385330  0.475554 11.000000  0.037930
C7     1   0.623140  0.384059  0.522099 11.000000  0.038030
C8      ...

求指教，楼上这种是不是苯环的无序处理啊？对于楼主说的五元环要怎么修呢，这个指令具体改那个部分，如果其中有原子是N，是不是跟C一样呢？
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3楼2013-11-01 11:06:05
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184696105

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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C5     1   0.783982  0.389310  0.472723 11.000000  0.056310
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C10    1   0.301438  0.113657  0.561510 11.000000  0.036590
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2楼2013-10-28 21:37:17
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caomeipai

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 184696105 at 2013-10-28 21:37:17
C5     1   0.783982  0.389310  0.472723 11.000000  0.056310
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C8      ...

求指教，这种是不是苯环的无序处理？对于楼主所说的五元环要怎么具体修改指令，如果其中有N原子是否跟C原子是一样的呢？万分感谢！！！
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4楼2013-11-01 11:08:51
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