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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » mpi并行问题
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qingtian510

银虫 (初入文坛)

[求助] mpi并行问题

LINUX的Redhat5.0系统，之前用mpirun -np 4 命令进行并行运算正常，一次非正常关机，再重启后，就不能正常运行了，依然可以四核同时计算，但是不是共同运算，而是每个核单独运行，也就是等于执行4次相同的运算，不知道哪里出现问题，觉得是软件的问题，有没有人遇到过这种问题，求大神指教啊
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奋斗吧，少年
1楼 2013-10-28 09:48:23
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qingtian510

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 腈水解酶1 at 2013-11-09 10:59:22
mpirun -np 4 后面的命令是单机版的吧？ 不是MPI版的 你用which命令查看一下 例如which ls
看看是不是你想要调用的那个MPI版本

不是单机版，就是并行版的，具体不知道什么问题，好像是跟AMBER串了，反正现在已经解决了，还是你提醒给了我灵感，谢谢你
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奋斗吧，少年
3楼2013-11-13 16:55:54
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腈水解酶1

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
qingtian510: 金币+5 2013-11-13 16:56:02
mpirun -np 4 后面的命令是单机版的吧？ 不是MPI版的 你用which命令查看一下 例如which ls
看看是不是你想要调用的那个MPI版本
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2楼2013-11-09 10:59:22
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qingtian510

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 腈水解酶1 at 2013-11-09 10:59:22
mpirun -np 4 后面的命令是单机版的吧？ 不是MPI版的 你用which命令查看一下 例如which ls
看看是不是你想要调用的那个MPI版本

[liangxihai@i7-106 ~]$ mpirun1 -np 4 mdrun_d -v -deffnm npt
mpdrun_9772 (mpd_send_one_msg 222): mpd_send_one_msg: sock=<socket object, fd=5, family=1, type=1, protocol=0> errmsg=32, 'Broken pipe'):
    mpdtb: (/home/program/mpich2/bin/mpdlib.py,222,mpd_send_one_msg) (/home/program/mpich2/bin/mpirun1.py,253,mpdrun) (/home/program/mpich2/bin/mpirun1.py,978,?)
mpdrun failed: no msg recvd from mpd when expecting ack of request
    traceback: [('/home/program/mpich2/bin/mpirun1.py', '256', 'mpdrun'), ('/home/program/mpich2/bin/mpirun1.py', '978', '?')]
现在只有这一台机子还出问题，是上边这样的问题，与其他机子出现的问题不同，我对过这台机子和其它机子上的一些文件，没找出有什么不同的地方，不知道哪里出错，还请你帮我看看呀，谢谢
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奋斗吧，少年
4楼2013-11-13 20:26:10
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