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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于拟南芥mapping遇到的很严重的问题
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bobby7513

新虫 (小有名气)

[求助] 关于拟南芥mapping遇到的很严重的问题

是这样的，实验室用两个拟南芥自然突变体，在一定压力下有很明显的表型差别，杂交F1是显性，F2分离比是37:37:25，然后继续往下做，定位到一定区间后，测基因型显示，部分表型和基因型对不上，其他多数都一致（正是用这些定位的），问题来了，不敢再往下做了，不知道大家能不能分析下，为何在定位到一定区间后，F2表型基因型不一致？如何继续往下做？谢谢你了。
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1楼 2013-10-20 16:32:48
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sun_in_night

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by bobby7513 at 2013-11-19 18:43:56
sorry，我说的应该是col 和ler的生态型，要是突变体反倒会好做了，f2的分离比表型共线性，为了继续往下做，而划定的，目的是为表型检测...

我说一下我的理解吧：你把Col的mutant和ler的WT杂交，然后他们的F2代你得到37:37:25的分离比？这个怎么来的？不是应该是3:1吗？
你说的表型和基因型对不上是什么意思？表型是你的mutant的吧，但基因型是什么？你不是在做mapping吗，你怎么能确定mutant的基因型？好混乱
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9楼2013-11-20 22:32:39
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steler_ly

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不能回答你的问题。 但是，依据你讲的，有没可能与表观遗传学有关。
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2楼2013-10-20 18:41:03
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nasi

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
bobby7513: 金币+3 2013-10-23 03:44:08
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-10-23 08:31:41
也许是你所找的定位区间不是真正的位置。也许是多位点控制的表型。再或者表型鉴定不够准确。请问是用连锁分析的方法做的，什么标记类型，标记密度多少？
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3楼2013-10-20 23:11:12
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bobby7513

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by nasi at 2013-10-20 23:11:12
也许是你所找的定位区间不是真正的位置。也许是多位点控制的表型。再或者表型鉴定不够准确。请问是用连锁分析的方法做的，什么标记类型，标记密度多少？

现在怀疑是多位点的，表型肯定有一定出入，但都是尽量客观评价的，基本符合3:1的，用的sslp，会不会是其他基因的干扰，应该怎么验证呢？
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4楼2013-10-23 03:46:43
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