24小时热门版块排行榜    

查看: 2077  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

bobby7513

新虫 (小有名气)

[求助] 关于拟南芥mapping遇到的很严重的问题

是这样的,实验室用两个拟南芥自然突变体,在一定压力下有很明显的表型差别,杂交F1是显性,F2分离比是37:37:25,然后继续往下做,定位到一定区间后,测基因型显示,部分表型和基因型对不上,其他多数都一致(正是用这些定位的),问题来了,不敢再往下做了,不知道大家能不能分析下,为何在定位到一定区间后,F2表型基因型不一致?如何继续往下做?谢谢你了。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobby7513

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by nasi at 2013-10-20 23:11:12
也许是你所找的定位区间不是真正的位置。也许是多位点控制的表型。再或者表型鉴定不够准确。请问是用连锁分析的方法做的,什么标记类型,标记密度多少?

现在怀疑是多位点的,表型肯定有一定出入,但都是尽量客观评价的,基本符合3:1的,用的sslp,会不会是其他基因的干扰,应该怎么验证呢?
4楼2013-10-23 03:46:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobby7513

新虫 (小有名气)

顶一下……
5楼2013-11-16 00:27:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobby7513

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sun_in_night at 2013-11-16 03:20:07
不是很懂你的意思,一般做拟南芥mapping不是都是Col和lan杂交吗?你怎么拿两个mutant杂交做mapping?而且这个37:37:25的分离比是什么意思?

sorry,我说的应该是col 和ler的生态型,要是突变体反倒会好做了,f2的分离比表型共线性,为了继续往下做,而划定的,目的是为表型检测
7楼2013-11-20 14:43:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobby7513

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by sun_in_night at 2013-11-20 22:32:39
我说一下我的理解吧:你把Col的mutant和ler的WT杂交,然后他们的F2代你得到37:37:25的分离比?这个怎么来的?不是应该是3:1吗?
你说的表型和基因型对不上是什么意思?表型是你的mutant的吧,但基因型是什么?你不 ...

是col和Ler两个生态型直接杂交(在一定压力下有显著差异),F2代表现为共显性,即有像Col 的,有像ler 的,也有介于中间的,他们的比例是我说的那个比例,应该是数量性状,所以没有3:1(这也是所有问题的症结所在),问题的问题在于,当利用我的筛选压力确定F2表型,锁定基因时,根据大多数line的表型,基于sslP,确定了基因在一定距离,他们的基因型为A或Aa或a时,表型和他们一致,但剩下的line其所拥有的表型和基因型有时完全相反,如基因型为A,但他的表型为a,这些为数也不少,所以我就不知道怎么继续往下做了
10楼2013-11-21 22:53:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobby7513

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by yxwjimmy at 2013-11-20 21:32:25
37:37:25的分离比是什么意思?怎么是3种表型呢?

是col和Ler两个生态型直接杂交(在一定压力下有显著差异),F2代表现为共显性,即有像Col 的,有像ler 的,也有介于中间的,他们的比例是我说的那个比例,应该是数量性状,所以没有3:1(这也是所有问题的症结所在),问题的问题在于,当利用我的筛选压力确定F2表型,锁定基因时,根据大多数line的表型,基于sslP,确定了基因在一定距离,他们的基因型为A或Aa或a时,表型和他们一致,但剩下的line其所拥有的表型和基因型有时完全相反,如基因型为A,但他的表型为a,这些为数也不少,所以我就不知道怎么继续往下做了
11楼2013-11-21 22:54:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobby7513

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by steler_ly at 2013-10-20 18:41:03
不能回答你的问题。 但是,依据你讲的,有没可能与表观遗传学有关。

我不懂表观遗传学。
12楼2013-11-21 22:55:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobby7513

新虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by sun_in_night at 2013-11-22 09:31:06
额,数量性状。。。说实话,不是很清楚数量性状的mapping。。。但数量性状很多是多基因决定的,这会不会是你的原因呢?你好像在定位单基因。...

希望这个数量性状有主效基因
14楼2013-11-22 15:05:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 bobby7513 的主题更新
信息提示
请填处理意见