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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于拟南芥mapping遇到的很严重的问题
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bobby7513

新虫 (小有名气)

[求助] 关于拟南芥mapping遇到的很严重的问题

是这样的，实验室用两个拟南芥自然突变体，在一定压力下有很明显的表型差别，杂交F1是显性，F2分离比是37:37:25，然后继续往下做，定位到一定区间后，测基因型显示，部分表型和基因型对不上，其他多数都一致（正是用这些定位的），问题来了，不敢再往下做了，不知道大家能不能分析下，为何在定位到一定区间后，F2表型基因型不一致？如何继续往下做？谢谢你了。
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1楼 2013-10-20 16:32:48
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sun_in_night

木虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by bobby7513 at 2013-11-21 02:53:39
是col和Ler两个生态型直接杂交（在一定压力下有显著差异），F2代表现为共显性，即有像Col 的，有像ler 的，也有介于中间的，他们的比例是我说的那个比例，应该是数量性状，所以没有3:1（这也是所有问题的症结所在） ...

额，数量性状。。。说实话，不是很清楚数量性状的mapping。。。但数量性状很多是多基因决定的，这会不会是你的原因呢？你好像在定位单基因。
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13楼2013-11-22 09:31:06
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steler_ly

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不能回答你的问题。 但是，依据你讲的，有没可能与表观遗传学有关。
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2楼2013-10-20 18:41:03
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nasi

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
bobby7513: 金币+3 2013-10-23 03:44:08
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-10-23 08:31:41
也许是你所找的定位区间不是真正的位置。也许是多位点控制的表型。再或者表型鉴定不够准确。请问是用连锁分析的方法做的，什么标记类型，标记密度多少？
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3楼2013-10-20 23:11:12
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bobby7513

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by nasi at 2013-10-20 23:11:12
也许是你所找的定位区间不是真正的位置。也许是多位点控制的表型。再或者表型鉴定不够准确。请问是用连锁分析的方法做的，什么标记类型，标记密度多少？

现在怀疑是多位点的，表型肯定有一定出入，但都是尽量客观评价的，基本符合3:1的，用的sslp，会不会是其他基因的干扰，应该怎么验证呢？
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4楼2013-10-23 03:46:43
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