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宜初xx

铜虫 (初入文坛)

[求助] cufflinks问题求助

植物转录组高通量测序数据，做差异表达分析，用tophat-cufflinks，cufflinks运行完成后得到的transcripts.gtf为0，报错如下：

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SAM error on line 34127475: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34178143: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34186043: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34210002: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34258453: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34268289: CIGAR op has zero length
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SAM error on line 34352836: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34388695: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34424573: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34435716: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34441799: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34459558: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34467635: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34635079: CIGAR op has zero length
SAM error on line 34781892: CIGAR op has zero length
> Processed 0 loci.                            [*************************] 100%

哪位高手帮忙给看看吧？谢谢
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1楼 2013-10-11 09:31:14
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