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DS2.5问题求助
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使用DS2.5进行分子对接时，如何评价libdock，ligandfit以及CDOCKER对接结果的好坏？ 使用libdock进行分子对接时，如何在对接结果中看RMSD值？ |
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yaozhq
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5楼2013-10-22 09:54:07
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- 专业: 药物设计与药物信息
| align protein-ligand crystal complex and protein-ligand docking complex, then calculate RMSD. it will be better that RMSD between crystal conformation and docking comformation is < 1.0. The docking comformation whose RMSD is closest to the crystal conformation suggest the sigficance of the docking method. |
4楼2013-10-13 08:56:59
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