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1989青苹果铁杆木虫 (职业作家)
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细菌全基因组测序 已有2人参与
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细菌全基因组测序的DNA提取是不是不能用一般的提取方法？那么有哪些方法可以提取DNA用来做全基因组测序呢？ [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
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2楼2013-10-16 09:59:12
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| 目前有效提取细菌菌株总DNA的方法,分别有SDS法、CTAB-SDS法、试剂盒法和改良试剂盒法。湖南师范大学生命科学学院曾对对苏云金芽胞杆菌、粘细菌和放线菌进行总DNA的提取、电泳检测、NanoDrop 2000测定、PCR扩增.对放线菌和苏云金芽胞杆菌,用改良试剂盒法所提取的总DNA纯度较高,电泳条带清晰,DNA主带位于23 kb,单位体积菌液所提取到的总DNA较SDS法和CTAB-SDS法高,能满足下游的PCR扩增等分子操作.对待测样品所做的质检报告也证实样品合格,可用于后续建库、测序.而粘细菌提取到的总DNA由于它们的OD260/230在2.0以下,没有达到第三代测序样品的要求.改良试剂盒法所提取到的总DNA大多数可以满足第三代测序技术样品制备的要求。天津生物芯片PacBio SMRT三代测序技术不仅可以得到长读长以及高准确率的序列，简化了细菌完成图的组装，而且，在测序中直接识别碱基修饰，在原始数据中获得细菌表观遗传的数据。 |
3楼2018-06-14 10:45:58
