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lvsihan

银虫 (正式写手)

[求助] 兽疫链球菌马疫链球菌基因组DNA提取 已有1人参与

兽疫链球菌马疫链球菌基因组DNA提取时,因为具有荚膜等多糖成分,在通过生工试剂盒提取的过程中,是否会导致基因组DNA提取不纯,以及解决办法。
亲,希望能够完整回答问题,拿金币是要负责人滴!!!
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铁虫 (小有名气)


【答案】应助回帖


lvsihan(kx444555代发): 金币+1, 鼓励交流 2013-10-16 10:27:49
细菌基因组DNA的制备
  一、材料
  细菌培养物。
  二、设备
  移液管, 高速冷冻离心机, 台式离心机,水浴锅。
  三、试剂
  1、CTAB/NaCl溶液:4.1g NaCl溶解于80ml H2 O,缓慢加入10g CTAB,加水至100ml。
  2、其它试剂:氯仿:异戊醇(24:1),酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),异丙醇,70% 乙醇,TE,10% SDS,蛋白酶 K (20mg/ml或粉剂),5mol/L NaCl。
  四、操作步骤:
  1. 100ml 细菌过夜培养液, 5000rpm离心10分钟, 去上清液。
  2. 加9.5ml TE悬浮沉淀, 并加0.5ml 10% SDS, 50μl 20mg/ml(或1mg干粉)蛋白酶 K, 混匀, 37℃保温1小时。
  3. 加1.5ml 5mol/L NaCl, 混匀。
  4. 加1.5ml CTAB/NaCl溶液, 混匀, 65℃保温20分钟。
  5. 用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提, 5000rpm离心10分钟, 将上清液移至干净离心管。
  6. 用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提, 取上清液移至干净管中。
  7. 加1倍体积异丙醇, 颠倒混合, 室温下静止10分钟,沉淀DNA。
  8. 用玻棒捞出DNA沉淀, 70%乙醇漂洗后, 吸干,溶解于1ml TE, -20℃保存。如DNA沉淀无法捞出,可5000rpm离心, 使DNA沉淀。
  9. 如要除去其中的RNA, 可以按本章第三节中操作步骤处理。


质粒DNA的提取与纯化

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质粒DNA的提取和纯化

1 质粒DNA的提取
质粒DNA是细菌细胞中小的共价闭合环状双链DNA。由于基因工程中使用的载体主要是质粒,因此,质粒DNA的提取和纯化是进行基因工程的重要前提。提取质粒DNA的方法很多,下面介绍几种有代表性的程序。
1)酚提取法
2)碱提取法 其基本原理是在溶菌酶和SDS破壁释放DNA后,在强碱条件下,DNA变性成单链,当加醋酸钠(NaAc)适当中和pH时,质粒DNA复性;而Ch-DNA和大分子RNA仍为单链并与蛋白质-SDS复合物被高盐沉淀,质粒DNA留在溶液中。不需经酚氯仿抽提,即可直接用乙醇沉淀上请中的p-DNA)。
3)煮沸提取法 此法快速简便,既可小规模检验也可大规模制备质粒DNA。其基本原理是在溶菌酶和Triton破壁释放DNA后,迅速煮沸,使Ch-DNA和蛋白质沉淀,质粒DNA留在溶液中。
2 质粒DNA的纯化(PCR产物的纯化)
(1)加入0.1倍体积的10×STE缓冲液
⑵ 加入等体积的4 mol/L NH4Ac
⑶ 加入2.5倍体积室温放置的无水乙醇
⑷ 立即在室温下12 000r/min, 离心10 min,使DNA沉淀,小心地去掉上清
⑸ 加入200μl的70%(V/V)乙醇
⑹ 室温下12 000r/min, 离心10 min,小心地去掉上清,干燥
⑺ 用与原样品体积相等(或减小体积以使样品浓缩)的TE缓冲液重悬DNA,放置4℃待用, 或-20℃贮存。

  

来源:百博明创(北京)
2楼2013-10-16 10:26:52
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马恋球君

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我们实验室用过天根试剂盒、omega试剂盒效果都还行,破壁的话可以考虑加透明质酸酶呢
3楼2017-01-03 12:10:32
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