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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » LAMMPS 里面如何算原子层间距
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银虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS 里面如何算原子层间距

想要看接近表面的几层原子之间的层间距，lammps里面如何实现，或者用Atomeye看算出dump文件中的原子层间距吗？
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1楼 2013-09-13 20:59:48
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tudragon

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

计算之前，先把各层原子分别定义为不同的group，计算中算各层原子在本层法线方向上的坐标的投影的平均值，然后输出出来即可。
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2楼2013-09-27 22:10:00
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cgzhang_gg

铜虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

可以把相邻的两层原子定义为不同的group，然后求出各自group 的重心分量，相应的命令是Xcm(group-ID,dim)
重心分量的差即为相邻两层原子之间的距离。xcm（）具体用法可以见variable 命令中的xcm说明。然后就可以用thermo/thermo_style 命令导出其值。
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3楼2013-09-30 19:56:23
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