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高斯中固定二面角作优化
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tangjia16888
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高斯中固定二面角作优化
固定一个分子的不同二面角作优化,请问输入文件是怎么样的,我现在做出来的是固定二面角相关的原子,但是这样键长也就固定了,请路过的高手告知,如何只固定二面角,键长仍可变化,作一个分子的优化,非常感谢!!!
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1楼
2013-09-11 18:18:37
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tangjia16888
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3楼
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Originally posted by
bittersmile
at 2013-09-11 22:55:24
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然后在坐标后空一行,指定二面角:
D #1 #2 #3 #4 F
多谢高手帮忙,但是有个问题不明白,#1 #2 C#3 #4是什么意思,能具体说明吗,我使用的是XYZ坐标,固定一个分子的一部分原子构成的二面角,,#1 #2 C#3 #4中1 2 3 4是指的原子序数还是什么?
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4楼
2013-09-12 08:22:32
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t13340033021
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甲烷无敌
2楼
2013-09-11 19:03:51
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bittersmile
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tangjia16888: 金币+10,
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很有帮助, 非常有用
2013-09-12 08:18:50
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然后在坐标后空一行,指定二面角:
D #1 #2 #3 #4 F
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3楼
2013-09-11 22:55:24
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bittersmile
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4楼
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tangjia16888
at 2013-09-12 08:22:32
多谢高手帮忙,但是有个问题不明白,#1 #2 C#3 #4是什么意思,能具体说明吗,我使用的是XYZ坐标,固定一个分子的一部分原子构成的二面角,,#1 #2 C#3 #4中1 2 3 4是指的原子序数还是什么?...
一个二面角需要指定四个原子,这个号码1234指的就是这四个原子的编号,也就是它们在坐标中的顺序号。
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5楼
2013-09-12 10:15:54
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