应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 参照菌株如何查找
51/1返回列表
查看: 2384  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

myapple1989

铁虫 (小有名气)

[求助] 参照菌株如何查找

发现一株疑似新的放线菌菌种，现在需要做DNA杂交，不知道怎样获取参照菌株，现在急用，望大神给予指导，谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-09-09 11:23:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

myapple1989

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 802311820 at 2013-09-11 16:39:36
模式菌株的编号前面会有相应保藏中心的缩写，常见的国外的菌种保藏机构有以下几个：
美国典型微生物菌种保藏中心（ATCC）
美国农业研究菌种保藏中心（NRRL）
德国微生物菌种保藏中心（DSMZ）
荷兰微生物菌种保藏 ...

那是直接在他们的网站里找呢还是通过其他的途径，找到之后怎么和他们联系来获得 我所需要的菌
赞一下 回复此楼
10楼2013-09-11 18:29:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

libranjie

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你是不是可以先用通用引物把16S RNA测序完成，跟NCBI 进行一下blastn比对（16S RNA库）得到最相近的物种，然后来借以确定物种信息。之后做不做杂交完全是选择而已的事了。
赞一下 回复此楼
2楼2013-09-09 12:25:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

myapple1989

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by libranjie at 2013-09-09 12:25:38
你是不是可以先用通用引物把16S RNA测序完成，跟NCBI 进行一下blastn比对（16S RNA库）得到最相近的物种，然后来借以确定物种信息。之后做不做杂交完全是选择而已的事了。

16s rRNA测序已经完成，，也比对了，相似度比较低，新种的可能性极高，建系统进化树后，找到了亲缘关系最近的参照菌株，需要做生理生化实验，可是这个参照菌株应该怎么获得呢
赞一下 回复此楼
3楼2013-09-09 15:37:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

libranjie

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by myapple1989 at 2013-09-09 15:37:00
16s rRNA测序已经完成，，也比对了，相似度比较低，新种的可能性极高，建系统进化树后，找到了亲缘关系最近的参照菌株，需要做生理生化实验，可是这个参照菌株应该怎么获得呢...

相似度比较低是首要问题。

1、16S序列PCR质量如何？
2、16S序列的测序质量又如何？
3、比对质量如何？但愿你没有比错数据库，细菌16S，NCBI有的。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6335505&authorid=2535241 有介绍的比较详细。

如果所有以上均没有问题，那才应该走到下一步找亲缘的参照菌株做生理生化实验。
赞一下 回复此楼
4楼2013-09-09 17:08:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组 +7 hualkop 2026-04-12 7/350 2026-04-12 14:09 by 380984326
[考研] 313求调剂 +5 余摆摆是大哥 2026-04-11 5/250 2026-04-12 10:34 by 猪会飞
[考研] 308求调剂 +5 VvvvL 2026-04-10 5/250 2026-04-12 10:17 by babysonlkd
[考研] 22408调剂315分 +3 zhuangyan123 2026-04-09 3/150 2026-04-12 00:25 by 蓝云思雨
[教师之家] 请问地理、遥感方面，可以做哪些横向项目啊，纵向完不成考核啊 +3 锦衣卫寒战 2026-04-07 5/250 2026-04-11 20:51 by 豫椒
[考研] 271求调剂 +21 2261744733 2026-04-11 21/1050 2026-04-11 20:19 by Angchemist
[考研] 求调剂 +6 电气300求调剂不 2026-04-08 6/300 2026-04-11 20:14 by 逆水乘风
[考研] 求调剂，一志愿大连理工大学354分 +5 雨声余生 2026-04-11 6/300 2026-04-11 16:12 by 雨声余生
[考研] 材料与化工调剂 10+11 下一站上岸@ 2026-04-10 36/1800 2026-04-11 10:26 by 89436494
[考研] 22408 327分求调剂 +4 韵风kon 2026-04-10 4/200 2026-04-11 09:51 by 猪会飞
[考研] 263能源动力专硕求调剂 +3 加大号饭盒袋 2026-04-10 3/150 2026-04-10 22:23 by 286640313
[考研] 求调剂 +5 不会飞的鱼@ 2026-04-10 5/250 2026-04-10 19:07 by chemisry
[考研] 生物学求调剂 一志愿沪9，326分 +7 刘墨墨 2026-04-06 7/350 2026-04-10 08:11 by kangsm
[考研] 材料专硕调剂 +16 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-07 17/850 2026-04-09 21:16 by wutongshun
[考研] 368化学求调剂 +13 wwwwabcde 2026-04-07 14/700 2026-04-09 14:47 by heaven_jay
[考研] 材料工程322 +18 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-07 19/950 2026-04-09 10:44 by cymywx
[考研] 328求调剂 +17 lftmya 2026-04-07 18/900 2026-04-09 08:05 by 5268321
[考研] 专硕0854初试考材科基，求调剂 +7 3220548044 2026-04-06 10/500 2026-04-08 21:59 by hypershenger
[考研] 304求调剂 +16 c297914 2026-04-05 17/850 2026-04-08 13:00 by grayjzr
[考研] 318求调剂 +5 李青山山山 2026-04-07 5/250 2026-04-07 18:24 by 蓝云思雨
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭