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hellohuo

金虫 (小有名气)

[求助] 提RNA的技术问题以及改进的建议

1.我用的是天根的提取液;
2.操作都是在冰上进行,但是提出来的结果还是不理想;
3.在氯仿抽提的时候,也尽量没有抽到中间的沉淀及下面的液体。
但是这样的结果很不理想,我要做QPCR,所以要对RNA的质量要求比较高,故请教各位大虾,希望大家能给一些改进的意见和建议,越多越好,谢谢~~~
提RNA的技术问题以及改进的建议
2013.8.6RNA提取.JPG

[ Last edited by 1949stone on 2013-9-9 at 16:16 ]
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随波逐刘

新虫 (小有名气)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-05 14:34:42
引用回帖:
11楼: Originally posted by hellohuo at 2013-09-05 09:16:46
我提的是植物的叶子,我用的天根的提取液,对于多糖多酚的根是没问题的,也没有基因组污染。就是叶子的不行,降低了样品的量,可还是有点降解和基因组污染,所以很困惑为什么根的RNA没问题,叶子的问题反而比较大?...

有用过其他方法吗?我用CTAB法提过叶子的,还挺好的!
CTAB-LiCl沉淀法提取RNA
1. 将2×CTAB 提取液于65℃水浴锅中预热。取0.1-0.2g样品于液氮中研磨成粉末
2. 转入2ml离心管中,加700ul提取液,同时加20ulβ-巯基乙醇
3. 剧烈振荡混匀,65℃水浴10 min,期间振荡数次
4. 冷却到室温,加等体积氯仿:异戊醇(24:1),充分振荡,冰浴10min
5. 4℃,12000g,离心10 min
6. 取上清至新2ml离心管,重复上述步骤,再抽提1次
7. 取上清于1.5ml离心管中,加入1/4体积的10 mol/L LiCl溶液
8. 4℃条件下过夜,或-20℃下放置6 h 以上,使RNA 沉淀
9. 4℃,12000g,离心20 min,弃上清,获粗提的总RNA 沉淀
10. 用500ul ddH2O溶解,加等体积氯仿/异戊醇(24:1)再抽提1次
11. 4℃,12000g,离心10min
12. 取上清,加1/10体积3mol/LNaAc(PH5.2),混匀后,加等体积预冷的异丙醇,-20℃沉淀2-3h
13. 4℃,12000g,离心10min,弃上清,用75%乙醇洗沉淀2次
14. 短暂离心吸出多余液体,室温干燥,ddH2O溶解,-80℃保存
12楼2013-09-05 14:06:00
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ivyvampire

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你看我的贴更悲剧,唉,目前还没找到原因
2楼2013-09-03 17:43:45
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hellohuo

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ivyvampire at 2013-09-03 17:43:45
你看我的贴更悲剧,唉,目前还没找到原因

哎,提RNA是各种问题啊,你遇到了什么情况啊?
3楼2013-09-04 09:26:57
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随波逐刘

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-04 21:00:58
hellohuo: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-09-05 09:17:49
有基因组污染啊,降解也有点严重了,估计还是提取方法不太好,用过trizol没有,至少DNA去的比较干净。。可以试一下!
4楼2013-09-04 10:50:04
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