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SunnyRain0.0

金虫 (正式写手)

[求助] Gromacs4.6.3安装出错

这是我安装Gromacs的过程:
1、安装CMake   
   tar -xzvf cmake-2.8.11.2.tar.gz
   ./configure
   make
   make install

2、安装fftw
   tar -xzvf fftw-3.3.3.tar.gz
   ./configure --prefix=/opt/fftw-3.3.3-sse2 --enable-shared --enable-sse2
   make -j 8 (多核编译)
   make install

3、安装openmpi
   tar -xzvf openmpi-1.6.5.tar.gz
   ./configure
   make
   make install

4、安装Gromacs
   tar -xzvf gromacs-4.6.3.tar.gz
   CMAKE_PREFIX_PATH=/opt/fftw-3.3.3-sse2 CC=icc FC=ifort F77=ifort CXX=icpc LDFLAGS="-limf -lm" cmake ..   -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/gromacs-4.6.3   
   make -j 8
   make install

进行到红色部分时出错如下
[msi@localhost build]$ CMAKE_PREFIX_PATH=/opt/fftw-3.3.3 CC=icc FC=ifort F77=ifort CXX=icpc LDFLAGS="-limf -lm" cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/gromacs-4.6.3
-- No compatible CUDA toolkit found (v3.2+), disabling native GPU acceleration
-- Check if the system is big endian
-- Searching 16 bit integer
CMake Error at /usr/local/share/cmake-2.8/Modules/TestBigEndian.cmake:44 (message):
  no suitable type found
Call Stack (most recent call first):
  CMakeLists.txt:462 (test_big_endian)


-- Configuring incomplete, errors occurred!

本人第一次安装Gromacs,求高手指点啊

[ Last edited by SunnyRain0.0 on 2013-8-30 at 19:31 ]
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Ihaveonedream~
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yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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SunnyRain0.0: 金币+5, 有帮助 2013-09-27 22:47:45
你的icc和ifort编译器配置好了没?
2楼2013-09-02 10:16:55
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SunnyRain0.0

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yaozhq at 2013-09-02 10:16:55
你的icc和ifort编译器配置好了没?

这个我不太清楚  前天问过别人  貌似没有
Ihaveonedream~
3楼2013-09-03 08:41:18
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