| 查看: 1773 | 回复: 6 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
youngfi木虫 (小有名气)
|
[求助]
自由能求解
|
||
| 第一次用gromacs计算自由能。在计算水分子蒸发的自由能时,我使用的是已经优化的好的结构,为什么系统还是提示:1 particles communicated to PME node 16 are more than 2/3 times the cut-off out of the domain decomposition cell of their charge group in dimension y. This usually means that your system is not well equilibrated. 请问有没有谁做过自由能求解的,这是什么情况啊?能否给点有用的建议,感激ing。 |
» 猜你喜欢
0805求调剂
已经有5人回复
342求调剂
已经有7人回复
调剂
已经有6人回复
一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂
已经有3人回复
273求调剂
已经有4人回复
339求调剂
已经有3人回复
267求调剂
已经有7人回复
070300化学279求调剂
已经有11人回复
318求调剂
已经有3人回复
309分085801求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6119.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1541
- 在线: 700.9小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
|
在入门阶段,我先计算一条polymer在水溶液中的构象,遇到了这个问题。您说的分别优化是指先分别优化polymer和溶剂盒子,再把优化好的两者组合起来吗?怎么组合能说具体点吗?用什么命令? 发自小木虫Android客户端 |
6楼2016-01-14 23:03:56
sciencejoy
新虫 (著名写手)
- 应助: 436 (硕士)
- 金币: 11207.1
- 红花: 90
- 帖子: 2974
- 在线: 498小时
- 虫号: 802149
- 注册: 2009-07-02
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
2楼2013-08-29 08:41:16
youngfi
木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2419.9
- 散金: 15
- 红花: 1
- 帖子: 144
- 在线: 100.9小时
- 虫号: 1850824
- 注册: 2012-06-07
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

3楼2013-08-29 11:34:17
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6119.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1541
- 在线: 700.9小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
4楼2016-01-14 10:10:05














回复此楼