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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » Autodock 中能量的问题
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工大新生

银虫 (正式写手)

[求助] Autodock 中能量的问题

在使用Autodock对接生物大分子（DNA）和药物的时候，查看了对接结果的氢键能，发现形成好几个氢键，把这几个氢键能相加得到的总氢键能大于 the sum of Van der Waals energy, hydrogen bonding energy and desolvation free energy，如何解释这一问题？
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1楼 2013-08-22 10:37:52
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工大新生

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by caixin5120 at 2013-08-22 11:38:21
可以看看这个帖子，深入学习下autodock的说明书！
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5214127&fpage=1

如果您知道的话，可以详细的解释一下吗？
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7楼2013-08-23 21:09:20
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工大新生

银虫 (正式写手)
是不是the sum of Van der Waals energy, hydrogen bonding energy and desolvation free energy 中的氢键能不是各个氢键能之和？
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3楼2013-08-22 11:08:16
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caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以看看这个帖子，深入学习下autodock的说明书！
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5214127&fpage=1
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4楼2013-08-22 11:38:21
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工大新生

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by caixin5120 at 2013-08-22 11:38:21
可以看看这个帖子，深入学习下autodock的说明书！
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5214127&fpage=1

已经看过了没有相关的介绍
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5楼2013-08-22 17:30:12
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