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ZJHuang1

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问为什么用质谱看蛋白复合物的成分却没有打出我IP的蛋白?

想问一个质谱的问题,我用蛋白A的抗体来IP蛋白A,IP下来的蛋白复合物进行凝胶电泳,等条带跑至分离胶浓缩胶分界面时,即蛋白尚未互相分离时,将胶进行考染,将条带割下,消化后进行质谱,质谱打出了很多其他蛋白,但是却没有打出我IP的蛋白,但是按道理IP的蛋白A应该是量最多的才对,这是为什么?
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Penny2014

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ZJHuang1: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-08-19 14:27:29
yqbter: 金币+10, 传说中的处女帖,奖励是必须的。 2013-08-19 17:09:07
可以试下跑完整的SDS胶,跑完再割胶消化,有可能太多蛋白胰酶消化不好
2楼2013-08-19 14:08:38
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DBWJ

金虫 (小有名气)

IP下来的蛋白复合物可以直接做LC-MS-MS直接鉴定,这样我感觉比跑胶在酶解好多了
你跑的质谱是Maldi-TOF还是LC-MS啊?
3楼2013-09-05 10:48:51
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