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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请问为什么用质谱看蛋白复合物的成分却没有打出我IP的蛋白？
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ZJHuang1

铜虫 (小有名气)

[求助] 请问为什么用质谱看蛋白复合物的成分却没有打出我IP的蛋白？

想问一个质谱的问题，我用蛋白A的抗体来IP蛋白A，IP下来的蛋白复合物进行凝胶电泳，等条带跑至分离胶浓缩胶分界面时，即蛋白尚未互相分离时，将胶进行考染，将条带割下，消化后进行质谱，质谱打出了很多其他蛋白，但是却没有打出我IP的蛋白，但是按道理IP的蛋白A应该是量最多的才对，这是为什么？
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精诚所至，金石为开
1楼 2013-08-16 15:16:21
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Penny2014

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
ZJHuang1: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-08-19 14:27:29
yqbter: 金币+10, 传说中的处女帖，奖励是必须的。 2013-08-19 17:09:07
可以试下跑完整的SDS胶，跑完再割胶消化，有可能太多蛋白胰酶消化不好
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2楼2013-08-19 14:08:38
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DBWJ

金虫 (小有名气)
IP下来的蛋白复合物可以直接做LC-MS-MS直接鉴定，这样我感觉比跑胶在酶解好多了
你跑的质谱是Maldi-TOF还是LC-MS啊？
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3楼2013-09-05 10:48:51
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