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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

[求助] 关于使载体平末端环化的问题

嗯...............好久木有冒泡,决定核潜艇上浮一番~
刚好实验也有点问题,想求助各位
具体情况如下:
需要构建一个新载体,想法是从现有载体上直接去除一部分序列就会成为我要的载体,所以采用PCR的方法,反向扩增了这个载体我需要的部分,然后用激酶处理这个线性片段后,想用连接酶环化此片段。
问题出现在:
需要的载体片段约有11kb左右,环化线性片段会非常困难,我试过几次均未成功,看有些资料显示,越长的片段可能形成多聚体的概率会越大。

想问一下是否能有什么添加剂或者方法之类的,促进长片段DNA的自我环化连接呢?
盼高手出现,给予指点。或大家集思广益,共同探讨,共同进步~
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Let God do with it as He wills
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gyesang

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
既然你做了PCR,何不在上下游引物上都设计一个相同的酶切位点,跑完PCR胶回收,然后酶切,自连,类似于单酶切构建载体时的载体自连

你的环化不成功可能原因是你PCR产物磷酸化处理效果不好

我们不是经常将载体去磷酸化来防止载体自连吗?
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
8楼2013-07-31 22:23:58
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gyesang

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
atlanticwi: 金币+10, ★★★很有帮助, 嗯 谢谢斑竹的这个建议 2013-08-02 12:26:53
引用回帖:
9楼: Originally posted by atlanticwi at 2013-07-31 23:03:56
嗯........
       问题就出在这里,我需要的是去除载体的一段序列,但是不能加入任何一个碱基,因为这个构建好的载体要去做BiFC,加入碱基肯定会有影响。否则的话我是绝对不想玩平端自连的。
       问题肯定不 ...

你可以低浓度,大体积的连接,这样减少分子间碰撞机会,加大自连概率
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
10楼2013-08-01 00:36:58
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