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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 菌悬液中不同菌的定量分析
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古木天恕

木虫 (正式写手)

[求助] 菌悬液中不同菌的定量分析

我有一份混菌的发酵液（植物乳杆菌，短乳杆菌，肠膜明串珠菌，干酪乳杆菌），我想在培养一段时间后，检测他们含量的变化，有什么比较好的办法？最好简单些，成本低些。谢谢
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1楼2013-07-30 16:15:19
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cauxiaobear

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
实时荧光定量PCR？
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2楼2013-07-30 16:19:57
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youyou8285

铁虫 (初入文坛)
★ ★ ★
zhang8826857: 金币+3, 鼓励新虫 2013-07-30 18:24:14
用微生物群落的T-RFLP、DGGE、16SRT-PCR应该都可以做到，但是要求简单成本低的话 如果菌落形态不同 不知道CFU可不可行
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3楼2013-07-30 16:21:33
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hnhn66

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
DGGE 微生物群落结构分析 可以定性 定量个人感觉不是很准
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4楼2013-07-31 08:43:18
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圣迭戈

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我觉得得看你要选几个时间点，如果只是两三个的话可以做16S的克隆文库来确定各个菌株的比例，花费主要是测序费，但操作简单，不占用太多时间。
如果时间点多一些的话可能定量PCR更适合，放到文章里面也更有说服力。但你需要分别用不同的引物，得自己设计或者是查文献确认。
DGGE的话如果你以前做过那可以，没做过的话不太推荐，因为定量不太好，而且操作不容易。
T-RFLP也不错，如果自己没有仪器的话得送到外面公司做，你可以跟公司沟通一下，他们会给你一些建议。
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5楼2013-07-31 09:48:23
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古木天恕

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 圣迭戈 at 2013-07-31 09:48:23
我觉得得看你要选几个时间点，如果只是两三个的话可以做16S的克隆文库来确定各个菌株的比例，花费主要是测序费，但操作简单，不占用太多时间。
如果时间点多一些的话可能定量PCR更适合，放到文章里面也更有说服力。 ...

以前做过DGGE，但我一直以为那个只能定性······
T-RFLP如果送到外边做 大概一次多少钱呢？
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6楼2013-07-31 15:12:56
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见神一笑

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
定量的话，最好的是用实时定量PCR，花费也不多。再就是用T－RFLP，16S 文库也可以，不过测序花费比较多，DGGE就算了，做起来又麻烦又不准确
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好好努力
7楼2013-08-01 10:01:06
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圣迭戈

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 古木天恕 at 2013-07-31 15:12:56
以前做过DGGE，但我一直以为那个只能定性······
T-RFLP如果送到外边做 大概一次多少钱呢？...

DGGE要算的话算半定量，可以根据条带深浅估计丰度，但很不靠谱，还是别用了。
T-RFLP我没送到外面做过，价格的话你随便打个电话去了解一下就行了，各个公司应该都差不多。
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8楼2013-08-01 13:42:43
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