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antechamber遇到问题
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antechamber遇到问题
大家好,我做antechamber的教程时遇到这个问题了:antechamber -i sustiva_new.pdb -fi pdb -o sustiva.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2
后生成一个mopac.out文件 但是我生成的是sqm.out文件请问这是怎么回事呢?
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1楼
2013-07-24 16:25:09
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2楼
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Originally posted by
wangyan10
at 2013-07-26 13:26:16
这个没有问题吧?说的mopac.out是你参照amber在线教程上面是那么写的吧?而你做出来的是sqm.out,这个是没有问题的。只不过是amber版本不一样,调用的模块不一样而已。不影响结果。
嗯,我也刚弄明白,非常感谢!
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2013-07-27 13:49:13
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2013-08-02 13:58:19
这个没有问题吧?说的mopac.out是你参照amber在线教程上面是那么写的吧?而你做出来的是sqm.out,这个是没有问题的。只不过是amber版本不一样,调用的模块不一样而已。不影响结果。
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2楼
2013-07-26 13:26:16
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2013-08-02 13:58:37
那是两个不同的量化软件的模块,AMBER的新版本都用SQM了,不过也有参数可以选择
我记得官网上面有解释为什么用SQM的,好像是因为SQM可以更好的保证在不同的机器上计算的结果一致
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3楼
2013-07-26 20:47:30
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嗯,好的,我也看见了,谢谢你!
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4楼
2013-07-27 13:48:17
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