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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 请教下DL_poly原子的frozen问题
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金虫 (小有名气)

[求助] 请教下DL_poly原子的frozen问题

手册（4.04.2）140页：
ifrz  integer 'frozen' atom (if ifrz>0)

The integer nrept need not be specified if the atom/site is not frozen (in which case a value of 1 is assumed.)
这个意思是不是ifrz只要写一个大于0的数就表示固定上了？
接下来的一句话怎么理解?
小弟新手很不理解，望高人解惑。
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1楼 2013-07-09 21:26:25
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hplc303

金虫 (小有名气)
★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-07-24 17:00:22
引用回帖:
3楼: Originally posted by visualization at 2013-07-12 22:43:01
The integer nrept need not be specified if the atom/site is not frozen (in which case a value of 1 is assumed.)
这句话又怎么理解呢...

如果你不想frozen 原子的话，你就不需要给nrept 设定参数
例如：ATOMS       3
OW      16.000          -0.8200
HW      1.0080          0.41000
HW      1.0080          0.41000
只设定 atomic mass and charge 后面的nrept,ifrz,igrp就不用管了
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4楼2013-07-15 21:19:50
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hplc303

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
visualization: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-07-16 09:23:52
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-07-24 17:00:32
在FIELD文件中，ifrz 大于0就行，一般默认的都是1
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2楼2013-07-12 15:02:44
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金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hplc303 at 2013-07-12 15:02:44
在FIELD文件中，ifrz 大于0就行，一般默认的都是1

The integer nrept need not be specified if the atom/site is not frozen (in which case a value of 1 is assumed.)
这句话又怎么理解呢
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3楼2013-07-12 22:43:01
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金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by hplc303 at 2013-07-15 21:19:50
如果你不想frozen 原子的话，你就不需要给nrept 设定参数
例如：ATOMS       3
OW      16.000          -0.8200
HW      1.0080          0.41000
HW      1.0080          0.41000
只设定 atomic mass and  ...

5楼2013-07-16 09:23:45
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alanxy3000

银虫 (小有名气)
我也有相关的疑问，不知是否可以一起讨论下啊。 A number greater than 1 specified here indicates that the next (nrept - 1) entries in the CONFIG file are ascribed the atomic characteristics given in the current record.
The sum of the repeat numbers for all atoms in a molecule should equal the number specified
by the atoms directive.
请问楼主是否知道后面这两句又是什么意思呢？
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Athousandwordswillnotleavesodeepanimpressionasonedeed.
6楼2013-07-22 22:32:08
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alanxy3000

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by alanxy3000 at 2013-07-22 22:32:08
我也有相关的疑问，不知是否可以一起讨论下啊。 A number greater than 1 specified here indicates that the next (nrept - 1) entries in the CONFIG file are ascribed the atomic characteristics given in the ...

是否是说
ATOMS 3
Ti     47.8671     2.196
O      15.9994     -1.098
O      15.9994     -1.098
和
ATOMS 3
Ti     47.8671     2.196     1
O      15.9994     -1.098     2
表示的意义完全相同？
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Athousandwordswillnotleavesodeepanimpressionasonedeed.
7楼2013-07-22 23:01:58
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金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by alanxy3000 at 2013-07-22 22:32:08
我也有相关的疑问，不知是否可以一起讨论下啊。 A number greater than 1 specified here indicates that the next (nrept - 1) entries in the CONFIG file are ascribed the atomic characteristics given in the ...

这句话我也不太明白，尤其是（nrept-1）这个。
算例中Test1,
nummols 27
atoms 1000
Na+          22.9898         1.0  500
Cl-           35.453        -1.0  500
对应在CONFIG文件中，Na先重复500次，next entries指的是499，读完499之后，-1的498也ascribed the atomic characteristics given in the current record，一直减到0为止？不知道这样理解对不对。
大致理解之后就没在细究手册里这句话，还望高手指点。
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8楼2013-07-23 16:08:02
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金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by alanxy3000 at 2013-07-22 23:01:58
是否是说
ATOMS 3
Ti     47.8671     2.196
O      15.9994     -1.098
O      15.9994     -1.098
和
ATOMS 3
Ti     47.8671     2.196     1
O      15.9994     -1.098     2
表示的意义完全相同？...

我觉得你说的有道理，这样写在FIELD文件里对。
不过我觉得这样写有不好的地方，像小分子比如水，就没有写成
OW  .... 1
HW ..... 2. 写成这样不知道您是否算过实例可行不可行，我觉得理论上是可以的，就是您理解的那样。
如果大分子，分子里面有重复性质的原子的时候，如果这样做FIELD文件是不是增加难度了，自己写程序做FIELD的时候。
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9楼2013-07-23 16:12:15
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alanxy3000

银虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by visualization at 2013-07-23 16:12:15
我觉得你说的有道理，这样写在FIELD文件里对。
不过我觉得这样写有不好的地方，像小分子比如水，就没有写成
OW  .... 1
HW ..... 2. 写成这样不知道您是否算过实例可行不可行，我觉得理论上是可以的，就是您理解 ...

谢谢讨论。我是这么猜想，但是也没有权威来证实一下。有点儿没底。
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10楼2013-07-24 01:29:54
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