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applexixixi

木虫 (小有名气)

[求助] 如何研究预测蛋白的功能

各位朋友,通过对菌株的全基因组测序我得到一段ORF序列,预测功能与脂蛋白生物合成相关,我想知道这个蛋白到底是怎么作用的,以什么为底物在什么环境下反应生成什么产物,预期做个简单的模拟实验验证蛋白功能。
       有没有做过类似实验或者有相关知识的朋友提供下解决办法呢?先谢过。
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-20 19:59:57
applexixixi: 金币+5, 有帮助 2013-09-22 19:32:56
用PROSITE能够预测蛋白质的结构域、家族、功能位点及相关配置。

PROSITE:http://prosite.expasy.org

可参考:DNA和蛋白质序列数据分析工具.pdf
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6358121
但是此书写的太少了,对于预测蛋白质的功能。
3楼2013-09-19 20:18:35
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1989青苹果

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
applexixixi: 金币+5 2013-09-22 19:34:16
我也要做相关的,是不是可以通过基因敲除的手段来研究一下该ORF的功能,另外通过生物信息学分析应该也可以分析该基因相关的代谢通路的,希望我们可以多交流!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
仰望天空。
2楼2013-09-19 00:27:07
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2008101111

金虫 (正式写手)

学术江湖混子

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
applexixixi: 金币+5 2013-09-22 19:33:51
先根据序列信息做个生物信息学分析,再通过实验来验证预测结果
自主创业者,捣腾生物试剂
9楼2013-09-20 20:04:30
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