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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 酶切及构建载体问题
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doughtiness

新虫 (小有名气)

[交流] 酶切及构建载体问题 已有8人参与

大家好，请教大家个问题。以目的基因为模板，设计含有酶切位点（Kpnl and Xbal）的上、下游引物，进行PCR。将PCR产物克隆连接到PMD18-T，后来发现PMD18-T上同时也含有那两个酶切位点（Kpnl and Xbal），这样会影响将目的基因切下来的效率吗？我最终的目的是：要把目的基因插入到表达载体pPICZ中。
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1楼 2013-07-01 10:41:01
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doughtiness

新虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-07-03 23:09:30
一般有加保护碱基。酶切位点在末端的确会在一定程度上影响酶切效率，这还要看你用的是哪种限制酶。这些是设计带酶切位点的引物时要考虑的问题。...

我用的是Kpnl 和 Xbal
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16楼2013-07-06 16:00:07
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kx444555

至尊木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-07-01 11:15:34
看看两同样的酶切位点离点远不远，超过50BP的话跑胶还是可以看出来的，还有理论上酶切切完外面的酶切位点还会继续切里边的酶切位点的，酶适当多加一点
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星陈代谢
2楼2013-07-01 10:47:41
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chijing0225

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-07-02 02:38:34
影响不大，你可以适当延长酶切时间，构建好的载体要再送测序确定一下是不是只有你的目的条带
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3楼2013-07-01 13:47:14
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-07-02 02:38:43
问题不大，保证酶切充分的话回收的目的片段不会带多余的序列。话说回来了，既然设计了酶切位点，为什么不直接连入表达载体呢。
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4楼2013-07-02 00:46:31
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