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凝霜枫叶

银虫 (小有名气)

[求助] 蓝藻DNA提取,液氮研磨

虫友们,请问有木有用液氮研磨提取蓝藻DNA的呀?我之前没用过液氮研磨,也没见过别人怎么用液氮研磨的,周围也没有做植物的,就想跟大家请教一下用液氮研磨的注意事项,1:是不是一加进液氮就开始研磨(我发现研磨的时候会溅出来液氮)?研磨的时候用多大的力度?是沿着研钵的外围研磨吗?2:研磨之后不知道为什么我的样品不是干粉状,反而有些潮湿,不太好转;,3:还有就是研磨之后是直接把裂解液加到研钵中还是转移之后再加?只研磨了两次,很多经验还木有,望各位虫友尤其是同样提蓝藻DNA的不吝赐教呀,因为样品比较少,所以不敢浪费,急急急……
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 凝霜枫叶 at 2013-06-28 20:47:32
我的藻一般是丝状的,不知道行不行...

丝状藻比单细胞藻更好破。蓝藻的细胞比较小,液氮研磨的效果不是很好。

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10楼2013-06-29 08:26:54
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
15楼: Originally posted by 凝霜枫叶 at 2013-07-02 08:51:33
那你实验室的protocol和酶学老方法都方便告诉我吗?真心感谢呀,,我的邮箱jiaoshujing1988@163.com,方便的话请发给我吧,...

我用的方法:
1. Scratch a loop of cells from a plate and resuspend cells into 0.5 ml of isolation buffer (50 mM Tris-HCl pH 8.5, 5 mM EDTA, 50 mM NaCl)
2. Add 10 μg DNase-free RNase
3. Add same volume of phenol, heat at 65°C for 5-10 min, mix 2-3 times in between
4. Extract 2 x with phenol:chloroform (1:1) and once with chloroform:amyalcohol (24:1), invert tubes gently by now and then for 5 min
5. Add 1 µg RNase, RT for 30 min
6. Add 1/10V 3M sodium acetate pH5.2, and 2V cold ethanol, store at -20 °C 2h or over night
7. Collect DNA at 14 000 g for 15 min, wash the pellet with 70 % ethanol.
8. Dissolve pellet into 100 µl of TE/water/ 5 mM Tris-HCl pH 8.
所得DNA的浓度大致为几百ng/μl,取0.5-1μl为模板做PCR即可。

酶学方法167卷的方法见附件:

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  • 附件 1 : 82[78]DNAtransformation.pdf
  • 2013-07-02 10:01:58, 580.58 K

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

16楼2013-07-02 10:02:25
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普通回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
凝霜枫叶: 金币+5, ★有帮助 2013-06-28 09:43:28
你的DNA做什么用?我一直用酚提的,效率不错。也有人按酶学方法上的老法子提。没用过液氮研磨。
2楼2013-06-28 00:09:12
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sinai

铁杆木虫 (著名写手)

Dr.

我不是做植物的,不过帮同学做过植物液氮研磨的,加入液氮后就研磨
偶尔幽生活一默你会觉得很爽,但生活幽你一默就惨了……
3楼2013-06-28 09:18:58
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凝霜枫叶

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sinai at 2013-06-28 09:18:58
我不是做植物的,不过帮同学做过植物液氮研磨的,加入液氮后就研磨

请问研磨的时候液氮会溅出来吗?
4楼2013-06-28 09:42:41
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凝霜枫叶

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-06-28 00:09:12
你的DNA做什么用?我一直用酚提的,效率不错。也有人按酶学方法上的老法子提。没用过液氮研磨。

我就是为了后续的PCR,要求不高,只要是纯基因组DNA就可以的,我用的试剂盒提取的
5楼2013-06-28 09:44:35
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
凝霜枫叶: 金币+5, ★有帮助 2013-06-28 20:47:03
引用回帖:
5楼: Originally posted by 凝霜枫叶 at 2013-06-28 09:44:35
我就是为了后续的PCR,要求不高,只要是纯基因组DNA就可以的,我用的试剂盒提取的...

做PCR的基因组DNA不用这么麻烦,直接用缓冲液重悬细胞,用酚破藻就可以了。便宜而且破碎效果很好。
6楼2013-06-28 13:16:01
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sinai

铁杆木虫 (著名写手)

Dr.

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
凝霜枫叶: 金币+5, ★有帮助 2013-06-28 20:47:45
那倒是没有,使劲磨就好了
偶尔幽生活一默你会觉得很爽,但生活幽你一默就惨了……
7楼2013-06-28 20:01:19
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凝霜枫叶

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-06-28 13:16:01
做PCR的基因组DNA不用这么麻烦,直接用缓冲液重悬细胞,用酚破藻就可以了。便宜而且破碎效果很好。...

我的藻一般是丝状的,不知道行不行
8楼2013-06-28 20:47:32
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凝霜枫叶

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by sinai at 2013-06-28 20:01:19
那倒是没有,使劲磨就好了

那看来还是我不会磨呀
9楼2013-06-28 20:48:01
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