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DGGE技术大虾请进
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胡小喜
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DGGE技术大虾请进
最近做细菌DGGE,发现下半部分的条带老是分不开,好像亮带成一团了。请大虾们教教我怎么调整变性剂浓度,才能把条带分开。我是用40-55%的变性剂浓度,8%的聚丙烯酰胺胶,150v电泳5h。请大虾们帮我分析下,怎样调整能把条带分开的漂亮点,谢谢!
IMG_4676.JPG
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2013-06-26 00:16:22
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胡小喜
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3楼
:
Originally posted by
jkf881213
at 2013-06-28 21:14:19
建议你做T-RFLP分析也可以的。比DGGE要精确,而且便宜
实验室没有DNA测序仪这种东西呢
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8楼
2013-07-01 18:51:03
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2013-06-28 19:46:07
胡小喜: 金币+3,
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2013-07-01 18:45:29
调整梯度,60,另外,跑的时间增加到8小时看看。建议不用dgge做多样性了,发sci的话比较老了,要加定量估计还差不多。建议高通量
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼
2013-06-28 15:04:31
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jkf881213
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
建议你做T-RFLP分析也可以的。比DGGE要精确,而且便宜
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3楼
2013-06-28 21:14:19
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elbo
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【答案】应助回帖
TRFlp分析如果要确定条带信息的话也需要进行克隆测序,而且引物,基因组浓度,扩增条件对结果影响大,高通量是大趋势,看看近两年发表的文章就知道了,而且一个样本如果只做测序,不做分析也就1500左右。
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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胡小喜
4楼
2013-06-29 15:28:40
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