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zx1990金虫 (小有名气)
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分子克隆
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| 请问测序公司反馈回来的序列，在你自己找到前后引物得到自己的序列之后，还要经过哪些详细过程，才能建成系统发育树，这个过程中分别是要保存成什么格式的文档？我还想知道.fasta格式的文件是起什么作用的？ |
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zx1990
金虫 (小有名气)
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3楼2013-06-22 09:01:16
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+5, 鼓励发帖应助！ 2013-06-21 21:00:51
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amisking: 金币+5, 鼓励发帖应助！ 2013-06-21 21:00:51
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第一、找到前后引物得到自己的序列,是为了确定你序列的正确性； 第二、一般来讲，构建系统发育树需要你对所获得的序列做碱基饱和性测验，而现在大家都不怎么重视这一步，直接用软件来建树。 第三、对于不擅长建树的同学或者MM来说，MEGA这个软件是比较适合你的了，现在这个软件已经更新到5.2版本了，免费的哦，提供邮箱，就可以下载了。 第四、构建进化树，需要你对所获得的多条序列进行比对，保存之后，再选择合适的建树方法，比如NJ什么的（常用NJ）。 第五、fasta文件是一种文件标准，使用这种格式，一般来说利于软件识别序列，特别是一个含有多序列的文件。 第六、如果你看完这些还不会的话，可以百度搜索“如何使用MEGA构建进化树”之类的。 第七、如果还不会，可以站内联系我，呵呵，我还是比较乐意帮助妹子同学的 希望可以帮助你，实验顺利哦~~  |
2楼2013-06-21 20:47:23
zx19904楼2013-06-29 17:31:38
zx1990
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多谢 5楼2013-06-30 11:46:33
