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分子克隆
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| 请问测序公司反馈回来的序列,在你自己找到前后引物得到自己的序列之后,还要经过哪些详细过程,才能建成系统发育树,这个过程中分别是要保存成什么格式的文档?我还想知道.fasta格式的文件是起什么作用的? |
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【答案】应助回帖
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amisking: 金币+5, 鼓励发帖应助! 2013-06-21 21:00:51
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amisking: 金币+5, 鼓励发帖应助! 2013-06-21 21:00:51
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第一、找到前后引物得到自己的序列,是为了确定你序列的正确性; 第二、一般来讲,构建系统发育树需要你对所获得的序列做碱基饱和性测验,而现在大家都不怎么重视这一步,直接用软件来建树。 第三、对于不擅长建树的同学或者MM来说,MEGA这个软件是比较适合你的了,现在这个软件已经更新到5.2版本了,免费的哦,提供邮箱,就可以下载了。 第四、构建进化树,需要你对所获得的多条序列进行比对,保存之后,再选择合适的建树方法,比如NJ什么的(常用NJ)。 第五、fasta文件是一种文件标准,使用这种格式,一般来说利于软件识别序列,特别是一个含有多序列的文件。 第六、如果你看完这些还不会的话,可以百度搜索“如何使用MEGA构建进化树”之类的。 第七、如果还不会,可以站内联系我,呵呵,我还是比较乐意帮助妹子同学的 希望可以帮助你,实验顺利哦~~ ![]() |

2楼2013-06-21 20:47:23
zx1990
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4楼2013-06-29 17:31:38
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