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dingxianlo

金虫 (正式写手)

[求助] 如何通过SNP进行精细定位

想问下能不能采用SNP作为标记进行质核互作不育系及其恢复系之间的恢复基因惊醒精细定位并且构建遗传图谱,如果可以的话,怎样做比较好,恳请大家指教一下
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dingxianlo

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yxwjimmy at 2013-06-08 12:09:35
当然可以啊。首先要有足够多的SNP标记已经开发出来。
用两个亲本筛选多态性SNP标记,利用合适的分离群体进行定位,精细定位后还需对候选基因进行转基因验证。

那这个足够多的SNP标记是将两个亲本的基因组进行比对找出,还是通过EST序列设计引物开发出来
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3楼2013-06-08 15:04:45
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yxwjimmy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
dingxianlo: 金币+2, 有帮助, 那这个足够多的SNP标记是将两个亲本的基因组进行比对找出,还是通过EST序列设计引物开发出来 2013-06-08 15:04:29
当然可以啊。首先要有足够多的SNP标记已经开发出来。
用两个亲本筛选多态性SNP标记,利用合适的分离群体进行定位,精细定位后还需对候选基因进行转基因验证。
2楼2013-06-08 12:09:35
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mumuwa

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

这个SNP标记的途径有很多,初步定位的时候,多利用该物种已经建立的SNP marker,在NCBI等数据库搜出,之后再加密标记,你所说的两种方法都可以建立新的标记
利用SNP标记定位的文章有很多很多,这个研究已经很深入了,你输入关键词找一下就会有很多出来的。
一起畅游生命科学世界吧
4楼2013-06-09 16:40:59
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