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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 生物信息学分析
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yanzixiang

银虫 (小有名气)

[求助] 生物信息学分析

谁能帮我看下这个图，为什么Glyco_hydro_10那一段是断开的。
如果是一个完整的aa序列应该是连续的吗？
我输入了一段aa序列，结果出来这么个图，谁能告诉我能在上边看出什么呀。不懂生物信息学分析。
生物信息学分析
1.png
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1楼 2013-05-27 16:38:31
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yanzixiang

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-05-27 18:18:47
标蓝色的区域是说电脑在分析的时候发现这段区域的氨基酸频率分布不正常, 所以在比较数据库的时候把这段屏蔽了.

有没有可能我拿到的这段序列是不对的呢
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3楼2013-05-27 19:29:48
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-05-28 01:19:16
yanzixiang: 金币+10 2013-09-13 18:52:55
标蓝色的区域是说电脑在分析的时候发现这段区域的氨基酸频率分布不正常, 所以在比较数据库的时候把这段屏蔽了.
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2楼2013-05-27 18:18:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励 应助 2013-05-28 08:21:29
yanzixiang: 金币+20 2013-09-13 18:53:21
引用回帖:
3楼: Originally posted by yanzixiang at 2013-05-27 19:29:48
有没有可能我拿到的这段序列是不对的呢...

你的序列应该不会有问题.
这个是电脑程序自动识别的, 打个比方, 如果你的蛋白序列"GA"这两个氨基酸连续出现10次, BLAST程序就会在计算的时候把这个GAGAGA...屏蔽掉. 但究竟是什么样的序列会被屏蔽我就不懂了.
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yanzixiang
4楼2013-05-27 19:51:31
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yanzixiang

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-05-27 19:51:31
你的序列应该不会有问题.
这个是电脑程序自动识别的, 打个比方, 如果你的蛋白序列"GA"这两个氨基酸连续出现10次, BLAST程序就会在计算的时候把这个GAGAGA...屏蔽掉. 但究竟是什么样的序列会被屏蔽我就 ...

嗯，好吧，我把它表达一下，看看有没有活性。谢谢你
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5楼2013-05-27 20:00:35
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