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华大基因发布生物信息学软件
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华大基因发布生物信息分析软件SOAP（Short Oligonucleotide Analysis Package） 七月六日，华大基因生物信息软件发布会在深圳举行。会上发布的生物信息软件是华大基因自主研发且广受业界欢迎的工具升级及扩展之最新力作，它们将为生物学家提供强有力的解决方案，使研究者能够更加方便地使用这些生物信息学工具进行实验设计及分析。 本次发布的生物信息软件主要包括三个方面：基础数据分析工具、群体遗传学分析工具和传统工具的优化升级版。华大基因科学技术部门负责人李英睿表示：“随着生物信息学在生命科学领域的作用日趋重要，生物信息学分析软件已成为生物学工作者做研究的必备工具。全新升级版的软件增加了多项新的功能，具有稳定性好、效率高等优点，可以支持动植物、微生物及人类疾病等领域的个体及群体多组学研究。通过这些软件工具可以对海量的原始数据进行分析、处理，使之成为具有明确生物学意义的信息，从而使人们能够更加深入地了解生物的起源、遗传、发育与进化的本质。” introduction SOAP has been in evolution from a single alignment tool to a tool package that provides full solution to next generation sequencing data analysis. Currently, it consists of a new alignment tool (SOAPaligner/soap2), a re-sequencing consensus sequence builder (SOAPsnp), an indel finder ( SOAPindel ), a structural variation scanner ( SOAPsv ) and a de novo short reads assembler ( SOAPdenovo ). And a GPU-accelerated alignment tool (SOAP3/GPU) are being implemented. 使用路径(http／／soap.genomics.org.cn／) |
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