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klaus1987

铜虫 (小有名气)

[求助] NAO轨道分析

我的最终目标是NPA电荷，它应该是由NAO轨道计算来的，那么就需要对NAO轨道做一些细致的分析。我用高斯pop=nboread输出了.31等一系列文件，然后将.33文件导入了multiwfn，在功能0里看到的轨道没有能量，占据数全部是1。直接用记事本打开.33文件，也没有能量，占据数的数据，只有大片矩阵。
然而，我看了下高斯计算输出的.out文件，里面也列出了NAO轨道，却是有占据数和能量数据的。我想请教一下，能否将.out文件里的占据数、能量数据手动加入.33文件，组成完整的结果文件，再用multiwfn之类的软件处理？
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klaus1987

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1楼 2013-05-21 08:58:30
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-05-21 14:32:11
klaus1987: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-22 09:09:58
klaus1987: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-05-22 22:33:32
.33格式里本身不记录能量数据。所有Multiwfn中涉及到NAO的功能都和能量无关，所以即便NAO的能量数据够能载入到Multiwfn也没有意义。
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klaus1987
2楼2013-05-21 12:11:34
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klaus1987

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2013-05-21 12:11:34
.33格式里本身不记录能量数据。所有Multiwfn中涉及到NAO的功能都和能量无关，所以即便NAO的能量数据够能载入到Multiwfn也没有意义。

我只是想拿NAO作图分析一下，主要是想看看静电势，如果有占据数和能量是不是就可以了？
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3楼2013-05-21 15:41:51
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
引用回帖:
3楼: Originally posted by klaus1987 at 2013-05-21 15:41:51
我只是想拿NAO作图分析一下，主要是想看看静电势，如果有占据数和能量是不是就可以了？...

静电势和NAO没有直接关系。分析静电势，就用普通计算得到的wfn/wfx或.fch文件就行了。
而且，计算静电势本身依赖的是轨道的密度，也和它的能量无关。
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4楼2013-05-21 18:15:12
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klaus1987

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2013-05-21 18:15:12
静电势和NAO没有直接关系。分析静电势，就用普通计算得到的wfn/wfx或.fch文件就行了。
而且，计算静电势本身依赖的是轨道的密度，也和它的能量无关。...

据说NPA电荷的静电势重现很差，我做下来也是这个感觉。做NAO轨道的静电势主要是想看看，NBO这一系列操作到底是在哪一步搞坏事的。
我试了直接用.33文件做静电势，结果是基本空的.
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5楼2013-05-22 09:10:22
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
引用回帖:
5楼: Originally posted by klaus1987 at 2013-05-22 09:10:22
据说NPA电荷的静电势重现很差，我做下来也是这个感觉。做NAO轨道的静电势主要是想看看，NBO这一系列操作到底是在哪一步搞坏事的。
我试了直接用.33文件做静电势，结果是基本空的....

原理上说，基于NAO和基于MO获得的静电势是完全一样的。
从程序的角度，Multiwfn没法靠NAO来得到正确的静电势。我不建议基于NBO输出的轨道来计算任何实空间性质（所有NBO输出的轨道中，只有靠NLMO轨道得到的实空间函数才和实际一致）

NPA静电势重现性差，是因为获得NPA的过程是基于希尔伯特空间的划分，而非考虑电子密度在实空间的分布。
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6楼2013-05-22 10:56:27
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klaus1987

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
哦，我再去看看NBO的文献
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7楼2013-05-22 22:34:05
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