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klaus1987

铜虫 (小有名气)

[求助] NAO轨道分析

我的最终目标是NPA电荷,它应该是由NAO轨道计算来的,那么就需要对NAO轨道做一些细致的分析。我用高斯pop=nboread输出了.31等一系列文件,然后将.33文件导入了multiwfn,在功能0里看到的轨道没有能量,占据数全部是1。直接用记事本打开.33文件,也没有能量,占据数的数据,只有大片矩阵。
然而,我看了下高斯计算输出的.out文件,里面也列出了NAO轨道,却是有占据数和能量数据的。我想请教一下,能否将.out文件里的占据数、能量数据手动加入.33文件,组成完整的结果文件,再用multiwfn之类的软件处理?
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sobereva

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-05-21 14:32:11
klaus1987: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-22 09:09:58
klaus1987: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-05-22 22:33:32
.33格式里本身不记录能量数据。所有Multiwfn中涉及到NAO的功能都和能量无关,所以即便NAO的能量数据够能载入到Multiwfn也没有意义。

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2楼2013-05-21 12:11:34
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klaus1987

铜虫 (小有名气)

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引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2013-05-21 12:11:34
.33格式里本身不记录能量数据。所有Multiwfn中涉及到NAO的功能都和能量无关,所以即便NAO的能量数据够能载入到Multiwfn也没有意义。

我只是想拿NAO作图分析一下,主要是想看看静电势,如果有占据数和能量是不是就可以了?
3楼2013-05-21 15:41:51
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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引用回帖:
3楼: Originally posted by klaus1987 at 2013-05-21 15:41:51
我只是想拿NAO作图分析一下,主要是想看看静电势,如果有占据数和能量是不是就可以了?...

静电势和NAO没有直接关系。分析静电势,就用普通计算得到的wfn/wfx或.fch文件就行了。
而且,计算静电势本身依赖的是轨道的密度,也和它的能量无关。
4楼2013-05-21 18:15:12
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klaus1987

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2013-05-21 18:15:12
静电势和NAO没有直接关系。分析静电势,就用普通计算得到的wfn/wfx或.fch文件就行了。
而且,计算静电势本身依赖的是轨道的密度,也和它的能量无关。...

据说NPA电荷的静电势重现很差,我做下来也是这个感觉。做NAO轨道的静电势主要是想看看,NBO这一系列操作到底是在哪一步搞坏事的。
我试了直接用.33文件做静电势,结果是基本空的.
5楼2013-05-22 09:10:22
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sobereva

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引用回帖:
5楼: Originally posted by klaus1987 at 2013-05-22 09:10:22
据说NPA电荷的静电势重现很差,我做下来也是这个感觉。做NAO轨道的静电势主要是想看看,NBO这一系列操作到底是在哪一步搞坏事的。
我试了直接用.33文件做静电势,结果是基本空的....

原理上说,基于NAO和基于MO获得的静电势是完全一样的。
从程序的角度,Multiwfn没法靠NAO来得到正确的静电势。我不建议基于NBO输出的轨道来计算任何实空间性质(所有NBO输出的轨道中,只有靠NLMO轨道得到的实空间函数才和实际一致)

NPA静电势重现性差,是因为获得NPA的过程是基于希尔伯特空间的划分,而非考虑电子密度在实空间的分布。
6楼2013-05-22 10:56:27
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klaus1987

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
哦,我再去看看NBO的文献
7楼2013-05-22 22:34:05
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