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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 大家帮忙看一下这个电荷密度
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 大家帮忙看一下这个电荷密度

现在有几个问题请教大家。我现在有一个形变的碳纳米管。然后希望得到“不同部位碳纳米管的电荷密度不同”这样的一个结论。然后我作了静态计算后得到了CHGCAR文件，然后导入到vesta。 得到图1（侧面图）和图2（其他角度图）然后感觉和大家展示的图差很多，后来调了调’properties‘里的’isosurfaces‘里的’level‘，从默认的0.10调到了0.01，然后得到了图感觉好了一些（图3和图4）。到这里我就有几个问题请教了：
1. 为什么感觉做的图和别人差别那么大呢？我感觉截面好像有点像，但是整体看看不出什么信息来？
2. 如果从我的图上能得到我想要的那个结论吗？
3. 不知道Bader分析和ELF能不能得到我所需要的分析？
4. 图3和图4外面出现的灰色的东东是啥？

图1.jpg



图2.jpg



图3.jpg



图4.jpg

[ Last edited by wangdading on 2013-5-14 at 17:47 ]
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前途是光明的，道路是曲折的。
1楼 2013-05-14 17:11:16
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
大家帮忙顶啊，别让帖子沉了。
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2楼2013-05-14 19:42:40
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
再顶啊，别沉了。大家帮帮忙啊。
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3楼2013-05-15 10:37:19
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wangdading at 2013-05-15 10:37:19
再顶啊，别沉了。大家帮帮忙啊。

后来用MaterialsStudio做了一个总电荷密度分布图，调过了之后如图所示。感觉好像电荷密度在底部和两侧没有啥差别。不知道我这么说对不对。

MS作图.jpg
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4楼2013-05-15 13:00:07
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xhzha at 2013-05-15 13:10:00
第四个问题会不会是你做截面时，也显示了0.01这个等密度面？

是啊，我选的比较小的时候菜户出现。但是我在用一个圆筒状的碳纳米管用相同的level显示电荷密度时，发现另一个就没有这个情况。我对这个理解不深，但是老板还抓着这个不放。我就不知道怎么给他一个合理的解释。
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6楼2013-05-15 16:17:10
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xhzha at 2013-05-15 13:10:00
第四个问题会不会是你做截面时，也显示了0.01这个等密度面？

补充一下，其实我在vesta中没有做截面。只是侧面显示的是这样子的。
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7楼2013-05-15 17:41:07
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by Physicser at 2013-05-15 18:49:27
希望得到“不同部位碳纳米管的电荷密度不同”这样的一个结论

既然如此 你应该画出不同截面在电荷密度，这样才更直观

我一直都在犹豫到底要不要画截面图，但是发现离域的电子云把其他颜色全盖住了。什么都看不到。只有周期性边缘结构才可以看到原子核和周围电子云的电荷密度。这也算是一个截面吧。不过不知道vesta能不能花截面呢？MS的话是可以话的。
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12楼2013-05-16 08:41:20
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xhzha at 2013-05-15 19:51:17
这软件我不熟悉，Xcrysden中是可以选择不显示等电荷面，只显示截面差分密度...

谢谢回帖帮助。请问我这个需要用到差分电荷密度吗？我觉得我这个问题不太适合啊。不想比如CO在金属上吸附那类问题可以看CO和金属电子转移。我这个没法做差啊。难道和没有形变的碳纳米管做差？几何形状改变了坐标都对不上了呀。
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13楼2013-05-16 08:43:41
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wangdading at 2013-05-15 13:00:07
后来用MaterialsStudio做了一个总电荷密度分布图，调过了之后如图所示。感觉好像电荷密度在底部和两侧没有啥差别。不知道我这么说对不对。

MS作图.jpg
...

再补充一下，二楼中MS是作了一个截面的电荷密度。
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14楼2013-05-16 08:48:34
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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by xhzha at 2013-05-15 19:57:58
圆筒状是不受力的吧，不同层原子从截面看过去是重叠的，而你受力变形后，不同层原子在截面上会不会有个错位，这样你就能看到其他层原子的等电荷面。在显示截面差分密度时，你所用软件不可以选择不显示等电荷面么？ ...

圆筒状确实是不受力的。但是形变的因为原子整体移动因此也不会有错位。你是不是想说明为啥图1和图2是那个样子的？还有就是我没有做差分。感觉我这个体系不适合做。毕竟不像是CO吸附在金属上，可以看两者之间的电荷转移。我这就一个体系。不能说去减掉原始圆筒状的碳纳米管的电荷密度吧？这样感觉结构不一样了，坐标对不上啊？
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15楼2013-05-16 08:52:04
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