应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？
91/1返回列表
查看: 2456  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

hee_csu

新虫 (著名写手)

[求助] QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？

已经有PbS3三配位结构的从头算结果，在做金属蛋白的QMMM模拟时，如何添加Pb的amber力场参数？（amber中没有Pb的力场参数）
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

amber

» 猜你喜欢
今天有点凉
1楼 2013-05-13 17:21:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haoguoyu

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hee_csu: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢 2013-05-14 10:44:55
gmy1990: 金币+1 2013-06-12 16:30:00
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

hee_csu
2楼2013-05-14 08:21:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

在高斯QMMM计算中，具体如何输入参数，能否给点资料或提示？
赞一下 回复此楼
今天有点凉
3楼2013-05-14 10:47:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～
赞一下 回复此楼
4楼2013-05-14 13:07:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yongleli at 2013-05-14 13:07:01
Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～...

麻烦虫友提供相关文献支持
赞一下 回复此楼
今天有点凉
5楼2013-05-14 18:45:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)
自己顶
回复此楼
今天有点凉
6楼2013-05-20 10:10:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yongleli at 2013-05-14 13:07:01
Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～...

虫友能否提供“Pb的参数早有人做了”的相关文献，谢谢！
赞一下 回复此楼
今天有点凉
7楼2013-06-12 09:27:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woainifei

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我也遇到类似的问题  顶一下
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2013-08-21 21:05:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

太极夫人

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

，计算完esp电荷后，怎样生成amber的resp电荷呢？需要什么软件？谢谢
赞一下 回复此楼
9楼2015-04-14 13:24:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hee_csu 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 4/200 2026-09-30 16:33 by Z9YWQ5EAO3qp
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 cqwQDCxMcL3I 2026-09-29 6/300 2026-09-30 16:26 by Z9YWQ5EAO3qp
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意！ +10 zju2000 2026-09-26 13/650 2026-09-30 10:26 by yexuqing
[有机交流] 同一个分子，一条来自文献，一条来自AI——不告诉你答案，你会选哪条？ +4 tianxiaoxian 2026-09-28 7/350 2026-09-30 08:34 by 88817753
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-29 19:27 by cqwQDCxMcL3I
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:47 by yCO1Ll7aHtsw
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:37 by etmYJ6d2rquH
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 4/200 2026-09-29 15:15 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:58 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:41 by etmYJ6d2rquH
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:13 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 7/350 2026-09-29 14:07 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-29 13:56 by etmYJ6d2rquH
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭