应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？
91/1返回列表
查看: 2168  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

hee_csu

新虫 (著名写手)

[求助] QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？

已经有PbS3三配位结构的从头算结果，在做金属蛋白的QMMM模拟时，如何添加Pb的amber力场参数？（amber中没有Pb的力场参数）
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

amber

» 猜你喜欢
今天有点凉
1楼 2013-05-13 17:21:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haoguoyu

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hee_csu: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢 2013-05-14 10:44:55
gmy1990: 金币+1 2013-06-12 16:30:00
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

hee_csu
2楼2013-05-14 08:21:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

在高斯QMMM计算中，具体如何输入参数，能否给点资料或提示？
赞一下 回复此楼
今天有点凉
3楼2013-05-14 10:47:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～
赞一下 回复此楼
4楼2013-05-14 13:07:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yongleli at 2013-05-14 13:07:01
Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～...

麻烦虫友提供相关文献支持
赞一下 回复此楼
今天有点凉
5楼2013-05-14 18:45:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)
自己顶
回复此楼
今天有点凉
6楼2013-05-20 10:10:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yongleli at 2013-05-14 13:07:01
Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～...

虫友能否提供“Pb的参数早有人做了”的相关文献，谢谢！
赞一下 回复此楼
今天有点凉
7楼2013-06-12 09:27:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woainifei

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我也遇到类似的问题  顶一下
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2013-08-21 21:05:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

太极夫人

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

，计算完esp电荷后，怎样生成amber的resp电荷呢？需要什么软件？谢谢
赞一下 回复此楼
9楼2015-04-14 13:24:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hee_csu 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 6/300 2026-04-19 13:00 by Aaron_zyn
[考研] 327求调剂 +27 Xxjc1107. 2026-04-13 30/1500 2026-04-19 08:22 by cuisz
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 一志愿沪9，326求生物学调剂 +12 刘墨墨 2026-04-13 12/600 2026-04-18 23:31 by 路病情
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考博] 申博/考博 +3 啃面包的小书虫 2026-04-17 4/200 2026-04-17 23:54 by 阳阳阳^_^
[考研] 一志愿华中农业071010，320求调剂 +17 困困困困坤坤 2026-04-14 19/950 2026-04-17 20:08 by 关一盏灯cd
[考研] 一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗 +10 否极泰来2026 2026-04-15 12/600 2026-04-17 17:54 by mapenggao
[考研] 294求调剂 +7 淡然654321 2026-04-17 8/400 2026-04-17 16:36 by wutongshun
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 297，工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +6 喽哈加油 2026-04-13 7/350 2026-04-16 14:31 by zhouxiaoyu
[考博] 申博自荐 +3 Linxia林夏 2026-04-13 3/150 2026-04-16 12:55 by 墨荷之露
[基金申请] RY：中国产出的科学垃圾论文，绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 一志愿A区211，22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 302求调剂 +10 易！? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭