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hee_csu

新虫 (著名写手)

[求助] QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数?

已经有PbS3三配位结构的从头算结果,在做金属蛋白的QMMM模拟时,如何添加Pb的amber力场参数?(amber中没有Pb的力场参数)
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今天有点凉
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数,把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后,生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw,键长,键角力常数等需要查。

Pb的参数早有人做了,RESP电荷是不好使的~
4楼2013-05-14 13:07:01
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haoguoyu

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
hee_csu: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢 2013-05-14 10:44:55
gmy1990: 金币+1 2013-06-12 16:30:00
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-05-14 08:21:04
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hee_csu

新虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数,把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后,生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw,键长,键角力常数等需要查。

在高斯QMMM计算中,具体如何输入参数,能否给点资料或提示?
今天有点凉
3楼2013-05-14 10:47:29
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hee_csu

新虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yongleli at 2013-05-14 13:07:01
Pb的参数早有人做了,RESP电荷是不好使的~...

麻烦虫友提供相关文献支持
今天有点凉
5楼2013-05-14 18:45:56
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