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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？
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hee_csu

新虫 (著名写手)

[求助] QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？

已经有PbS3三配位结构的从头算结果，在做金属蛋白的QMMM模拟时，如何添加Pb的amber力场参数？（amber中没有Pb的力场参数）
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amber

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今天有点凉
1楼 2013-05-13 17:21:57
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～
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4楼2013-05-14 13:07:01
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haoguoyu

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hee_csu: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢 2013-05-14 10:44:55
gmy1990: 金币+1 2013-06-12 16:30:00
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

hee_csu
2楼2013-05-14 08:21:04
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hee_csu

新虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

在高斯QMMM计算中，具体如何输入参数，能否给点资料或提示？
赞一下 回复此楼
今天有点凉
3楼2013-05-14 10:47:29
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hee_csu

新虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yongleli at 2013-05-14 13:07:01
Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～...

麻烦虫友提供相关文献支持
赞一下 回复此楼
今天有点凉
5楼2013-05-14 18:45:56
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