应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？
51/1返回列表
查看: 2030  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

hee_csu

金虫 (著名写手)

[求助] QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？

已经有PbS3三配位结构的从头算结果，在做金属蛋白的QMMM模拟时，如何添加Pb的amber力场参数？（amber中没有Pb的力场参数）
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

amber

» 猜你喜欢
今天有点凉
1楼 2013-05-13 17:21:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

太极夫人

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

，计算完esp电荷后，怎样生成amber的resp电荷呢？需要什么软件？谢谢
赞一下 回复此楼
9楼2015-04-14 13:24:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

haoguoyu

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hee_csu: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢 2013-05-14 10:44:55
gmy1990: 金币+1 2013-06-12 16:30:00
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

hee_csu
2楼2013-05-14 08:21:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hee_csu

金虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

在高斯QMMM计算中，具体如何输入参数，能否给点资料或提示？
赞一下 回复此楼
今天有点凉
3楼2013-05-14 10:47:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by haoguoyu at 2013-05-14 08:21:04
关于电荷参数，把你的构型做HF/6-31* 的esp电荷计算之后，生成amber的resp电荷就是电荷参数。vdw，键长，键角力常数等需要查。

Pb的参数早有人做了，RESP电荷是不好使的～
赞一下 回复此楼
4楼2013-05-14 13:07:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭