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xixi1007

木虫 (小有名气)

[求助] CHARMM力场的top文件问题

请问下图分子中两端C=O的原子类型应该怎么设置,是取酸的原子类型还是酯的原子类型啊。烦请高手给出下面分子的charmm力场的top,或是两端保护基(含C=O)的top形式。非常感谢!

untitled.jpg
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fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-05-09 14:02:37
你把做好的Pdb提交到这里吧,它会给你一个合适的top的

https://www.paramchem.org/
2楼2013-05-09 00:00:41
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