| 查看: 889 | 回复: 1 | ||
[求助]
CHARMM力场的top文件问题
|
请问下图分子中两端C=O的原子类型应该怎么设置，是取酸的原子类型还是酯的原子类型啊。烦请高手给出下面分子的charmm力场的top，或是两端保护基（含C=O）的top形式。非常感谢！ untitled.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
拟解决的关键科学问题还要不要写
已经有8人回复
-
最失望的一年
已经有12人回复
-
存款400万可以在学校里躺平吗
已经有29人回复
-
求推荐英文EI期刊
已经有5人回复
-
请教限项目规定
已经有4人回复
-
国自然申请面上模板最新2026版出了吗？
已经有20人回复
-
26申博
已经有3人回复
-
基金委咋了？2026年的指南还没有出来？
已经有10人回复
-
基金申报
已经有6人回复
-
疑惑？
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- top文件格式问题
已经有3人回复
- gromacs自己添加residue遇到的问题
已经有6人回复
- 生成psf时，出现unknown atom type
已经有14人回复
- 如何用MS的纳米管坐标转到gromacs可识别的文件
已经有7人回复
- 【求助】在NAMD运行中使用CHARMM格式的力场文件，但力场参数来自AMBER力场，会出问题�
已经有4人回复
fhh2626
木虫 (正式写手)
- 应助: 135 (高中生)
- 金币: 2354.1
- 红花: 7
- 帖子: 344
- 在线: 139小时
- 虫号: 1475956
- 注册: 2011-11-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-05-09 14:02:37
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-05-09 14:02:37
|
你把做好的Pdb提交到这里吧，它会给你一个合适的top的 https://www.paramchem.org/ |
2楼2013-05-09 00:00:41