24小时热门版块排行榜    

查看: 1856  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)

[求助] gromacs确定疏水性

gromacs跑出来以后,怎么样确定他的疏水性大小?我想比较前后的疏水性,请问怎么样解决??
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Gromacs

» 猜你喜欢

滴答
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

二当家的

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by wanglang1987 at 2013-04-23 21:29:12
可及化表面积?有相关文献吗?能不能给我一份?...

可及化表面积,这个也只是定性的分析,相关文献我倒没有,如果你用VMD的话,可以查下measure sassa命令
下苦功,三个字,一个叫下,一个叫苦,一个叫功,一定要振作精神,下苦功。
7楼2013-04-24 09:13:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ben_ladeng: 金币+2, 多多交流 2013-04-23 20:40:08
确定亲水疏水性的性质是根据你的参数确定的吧?

比如在martini 粗粒化力场中,水的珠子类型是  P4 , 如果你模拟的物质珠子类型是  C1 ,那么这种物质就是疏水的

[ Last edited by jiaoyixiong on 2013-4-23 at 10:25 ]
2楼2013-04-23 10:23:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-04-23 10:23:36
确定亲水疏水性的性质是根据你的参数确定的吧?

比如在martini 粗粒化力场中,水的珠子类型是  P4 , 如果你模拟的物质珠子类型是  C1 ,那么这种物质就是疏水的
...

你说的我不是很懂,我指的是蛋白质没加离子之前有个亲疏性,加完离子后有个亲疏性,我想比较他们的大小,请问怎么解决?
滴答
3楼2013-04-23 12:31:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wanglang1987 at 2013-04-23 12:31:41
你说的我不是很懂,我指的是蛋白质没加离子之前有个亲疏性,加完离子后有个亲疏性,我想比较他们的大小,请问怎么解决?...

那我也不清楚了,你需要再调研相关的文献
4楼2013-04-23 14:06:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 275求调剂 +5 shansx 2026-03-22 6/300 2026-03-22 13:01 by zhanglang93
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-21 6/300 2026-03-22 11:35 by plum李子
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +4 2117205181 2026-03-21 5/250 2026-03-22 11:30 by 杨杨杨紫
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 4/200 2026-03-22 11:04 by 搏击518
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +4 NIFFFfff 2026-03-20 4/200 2026-03-22 09:49 by 2026paper
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 310求调剂 +3 baibai1314 2026-03-16 3/150 2026-03-21 03:56 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +10 冷笙123 2026-03-17 10/500 2026-03-21 01:54 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 287求调剂 +7 晨昏线与星海 2026-03-19 8/400 2026-03-20 22:19 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
[考研] 0856调剂,是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见