24小时热门版块排行榜    

查看: 1859  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)

[求助] gromacs确定疏水性

gromacs跑出来以后,怎么样确定他的疏水性大小?我想比较前后的疏水性,请问怎么样解决??
回复此楼
滴答
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-04-23 10:23:36
确定亲水疏水性的性质是根据你的参数确定的吧?

比如在martini 粗粒化力场中,水的珠子类型是  P4 , 如果你模拟的物质珠子类型是  C1 ,那么这种物质就是疏水的
...

你说的我不是很懂,我指的是蛋白质没加离子之前有个亲疏性,加完离子后有个亲疏性,我想比较他们的大小,请问怎么解决?
滴答
3楼2013-04-23 12:31:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ben_ladeng: 金币+2, 多多交流 2013-04-23 20:40:08
确定亲水疏水性的性质是根据你的参数确定的吧?

比如在martini 粗粒化力场中,水的珠子类型是  P4 , 如果你模拟的物质珠子类型是  C1 ,那么这种物质就是疏水的

[ Last edited by jiaoyixiong on 2013-4-23 at 10:25 ]
2楼2013-04-23 10:23:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wanglang1987 at 2013-04-23 12:31:41
你说的我不是很懂,我指的是蛋白质没加离子之前有个亲疏性,加完离子后有个亲疏性,我想比较他们的大小,请问怎么解决?...

那我也不清楚了,你需要再调研相关的文献
4楼2013-04-23 14:06:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

二当家的

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-04-23 19:38:29
可以统计溶剂可及化表面积
下苦功,三个字,一个叫下,一个叫苦,一个叫功,一定要振作精神,下苦功。
5楼2013-04-23 15:58:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 考研调剂 +4 来好运来来来 2026-03-21 4/200 2026-03-22 12:15 by 星空星月
[考研] 一志愿华中科技大学071000,求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 307求调剂 +10 冷笙123 2026-03-17 10/500 2026-03-21 01:54 by JourneyLucky
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +12 墨墨漠 2026-03-18 13/650 2026-03-21 01:42 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +6 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 7/350 2026-03-21 01:03 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +4 一志愿京区211 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:41 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 287求调剂 +7 晨昏线与星海 2026-03-19 8/400 2026-03-20 22:19 by JourneyLucky
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
信息提示
请填处理意见