应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 形成能计算中，单原子能量计算问题。
71/1返回列表
查看: 2549  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

傻孩阿布

铁虫 (初入文坛)

[求助] 形成能计算中，单原子能量计算问题。

关于形成能的计算里头需要计算晶胞内的单个原子的化学势，也就是单个原子的能量吧，我算的体系是fe3c的，想分别算出fe原子和C原子的化学势，不知道如何计算。
1.建立一个大的空间结构，里头放入单个原子。这种方法，我不大会，求大神指点。因为初学，所以希望大神可以按步骤帮忙，大恩不言谢。
2.我是把fe3c那个晶胞里头的其他原子删除，只留下单个的fe原子或者是c原子，然后再进行几何优化，得到的能量是否就是单个原子的化学势呢？
希望大神可以不吝赐教，告知化学势的求法，不胜感激，不胜感激。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理计算-tg 不错哦

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-04-22 09:30:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzzaqxq

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-22 21:19:14
傻孩阿布: 金币+5, ★有帮助 2013-08-29 15:56:25
以C为例，
CASTEP只能处理周期性的体系。为了能够优化C分子的几何结构，我们必需把它放入晶格点阵中。
       选择New | 3D Atomistic Document.在3D Atomistic Document.xsd上右键单击，选中Rename。键入C，按下RETURN键，建立C.xsd文件。
        现在显示的是一个空3D模型文档。我们可以使用Build Crystal工具来创建一个空晶格单元，然后在上面添加C分子。

从菜单栏中选择Build | Crystals | Build Crystal，再选中Lattice Parameters标签，把每一个单元的长度a, b, 和 c改为8.00，按下Build按钮。在3D模型文档中显示出一个空单元。
从菜单栏选择Build | Add Atoms。
在Add Atoms对话框中，选择Options标签，确定Coordinate system为Cartesian。然后选中Atoms标签，按下Add按钮。
然后优化！
赞一下(1人) 回复此楼
勤能补拙是良训一分辛苦一分才
2楼2013-04-22 11:09:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

傻孩阿布

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zzzaqxq at 2013-04-22 11:09:49
以C为例，
CASTEP只能处理周期性的体系。为了能够优化C分子的几何结构，我们必需把它放入晶格点阵中。
       选择New | 3D Atomistic Document.在3D Atomistic Document.xsd上右键单击，选中Rename。键入C，按下 ...

谢谢。麻烦在问下，那cartesian和fractional这两种系统有什么差别呢？分别适用于什么类别呢？还有想问下，我自己提到的第二种方法是什么情况？有什么说法不？在线等。
赞一下 回复此楼
3楼2013-04-22 13:47:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tuyuan_whu

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-22 21:19:21
你好，我计算过形成能。

单原子的形成能，就是在一个大的空胞里放入一个原子，计算的total energy就是形成能。
单个原子坐标任意，比如 0 0 0，
晶胞格矢写的大一些，比如：
0 0 100
0 100 0
100 0 0

要是算一个分子的形成能，可以算出一个大胞的总能，除以这个大胞内的分子总数，就是形成能了。
赞一下 回复此楼
呵呵呵
4楼2013-04-22 14:20:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tuyuan_whu

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-22 21:19:26
傻孩阿布: 金币+5, ★有帮助 2013-08-29 15:56:40
另外，

如果是计算单个原子的形成能，我们就是要免除原子之间的，或者胞之间的相互作用。所以应该不存在一个弛豫优化的过程，所以你说的第二种情况，我不太知道是在什么情况下使用。
赞一下 回复此楼
呵呵呵
5楼2013-04-22 14:22:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tuyuan_whu

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 傻孩阿布 at 2013-04-22 13:47:53
谢谢。麻烦在问下，那cartesian和fractional这两种系统有什么差别呢？分别适用于什么类别呢？还有想问下，我自己提到的第二种方法是什么情况？有什么说法不？在线等。...

cartesian坐标和fractional坐标体系没有区别。一种是给出直接坐标，一种是给出该原子在abc三个方向的投影占据各个棱长的比例。如，晶胞的三条棱的位矢分别是
0 0 3
0 3 0
3 0 0

那么，晶胞中心位置对应的catesian坐标是：1.5 1.5 1.5
而fractional坐标是：0.5 0.5 0.5
赞一下(1人) 回复此楼
呵呵呵
6楼2013-04-22 14:27:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sungjen

银虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tuyuan_whu at 2013-04-22 14:20:42
你好，我计算过形成能。

单原子的形成能，就是在一个大的空胞里放入一个原子，计算的total energy就是形成能。
单个原子坐标任意，比如 0 0 0，
晶胞格矢写的大一些，比如：
0 0 100
0 100 0
100 0 0

要 ...

请问结合能和形成能算法一样吗？还有就是掺杂体系的结合能应该怎么算呢
赞一下 回复此楼
希望有一天成为大神
7楼2013-10-16 16:32:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 傻孩阿布 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 277求调剂 +23 倪建设 2026-04-06 23/1150 2026-04-13 00:40 by 王童子龙
[考研] 一志愿安大生物学07初试322、本科二本、调剂求助 +10 李多米lee. 2026-04-12 11/550 2026-04-12 22:58 by yuyin1233
[考研] 材料考研调剂 +27 云木达达 2026-04-11 29/1450 2026-04-12 22:48 by kyle12138
[考研] 材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组 +9 hualkop 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:41 by kyle12138
[考研] 293求调剂 +12 我爱高数高数爱� 2026-04-12 13/650 2026-04-12 21:32 by wangluhui
[考研] 291求调剂 +11 关忆北. 2026-04-09 12/600 2026-04-12 10:32 by 逆水乘风
[考研] 0854调剂 +12 长弓傲 2026-04-09 13/650 2026-04-12 09:56 by 逆水乘风
[考研] 332求调剂 +14 蕉蕉123 2026-04-10 14/700 2026-04-12 00:27 by 蓝云思雨
[考研] 331求调剂 +5 王国帅 2026-04-11 5/250 2026-04-11 22:56 by 溪涧流水
[考研] 267求调剂 +8 再忙也要吃饭啊 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:42 by cfdbai
[考研] 359求调剂 +5 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 19:55 by lbsjt
[考研] 本人女孩 +7 吼吼， 2026-04-10 9/450 2026-04-11 14:45 by ACS Nano——
[考研] 297求调剂 +9 Kwgyz 2026-04-09 9/450 2026-04-11 10:09 by zhq0425
[考研] 085402通信工程调剂，有4项学科竞赛国奖（电赛国二），硕士研究生调剂自荐信。 +5 m永o不v言o弃m 2026-04-09 5/250 2026-04-11 09:33 by zhq0425
[考研] 考研调剂 +26 硕星赴 2026-04-09 27/1350 2026-04-10 22:24 by 猪会飞
[考研] 机械专368 有去处吗 +4 种大树 2026-04-10 4/200 2026-04-10 15:31 by jiajinhpu
[考研] 348求调剂 +3 candyyyi 2026-04-09 3/150 2026-04-09 17:20 by 段伟艳
[考研] 本科郑州大学，一志愿华东师范大学282求调剂 +23 熊哥xtk 2026-04-07 26/1300 2026-04-09 17:17 by 18446523
[考研] 305求调剂 +4 77Qi 2026-04-06 4/200 2026-04-07 20:06 by shanqishi
[考研] 求助 +3 卡卡东88 2026-04-06 4/200 2026-04-06 15:28 by going home
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭